Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR59

Gadd45gip1, Growth arrest and DNA damage-inducible proteins-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gadd45gip1Q9CR59 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gadd45gip1Q9CR59 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gadd45gip1Q9CR59 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gadd45gip1Q9CR59 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Gadd45gip1Q9CR59 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gadd45gip1Q9CR59 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gadd45gip1Q9CR59 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gadd45gip1Q9CR59 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gadd45gip1Q9CR59 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gadd45gip1Q9CR59 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Gadd45gip1Q9CR59 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gadd45gip1Q9CR59 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gadd45gip1Q9CR59 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Gadd45gip1Q9CR59 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gadd45gip1Q9CR59 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gadd45gip1Q9CR59 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Gadd45gip1Q9CR59 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gadd45gip1Q9CR59 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gadd45gip1Q9CR59 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gadd45gip1Q9CR59 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gadd45gip1Q9CR59 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gadd45gip1Q9CR59 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gadd45gip1Q9CR59 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gadd45gip1Q9CR59 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gadd45gip1Q9CR59 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gadd45gip1Q9CR59 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Gadd45gip1Q9CR59 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Gadd45gip1Q9CR59 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gadd45gip1Q9CR59 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gadd45gip1Q9CR59 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gadd45gip1Q9CR59 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gadd45gip1Q9CR59 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Gadd45gip1Q9CR59 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Gadd45gip1Q9CR59 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gadd45gip1Q9CR59 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Gadd45gip1Q9CR59 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gadd45gip1Q9CR59 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gadd45gip1Q9CR59 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gadd45gip1Q9CR59 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gadd45gip1Q9CR59 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Gadd45gip1Q9CR59 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gadd45gip1Q9CR59 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gadd45gip1Q9CR59 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gadd45gip1Q9CR59 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gadd45gip1Q9CR59 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gadd45gip1Q9CR59 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gadd45gip1Q9CR59 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gadd45gip1Q9CR59 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gadd45gip1Q9CR59 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gadd45gip1Q9CR59 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gadd45gip1Q9CR59 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gadd45gip1Q9CR59 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gadd45gip1Q9CR59 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Gadd45gip1Q9CR59 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Gadd45gip1Q9CR59 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gadd45gip1Q9CR59 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gadd45gip1Q9CR59 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gadd45gip1Q9CR59 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Gadd45gip1Q9CR59 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gadd45gip1Q9CR59 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gadd45gip1Q9CR59 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gadd45gip1Q9CR59 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gadd45gip1Q9CR59 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gadd45gip1Q9CR59 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gadd45gip1Q9CR59 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gadd45gip1Q9CR59 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gadd45gip1Q9CR59 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gadd45gip1Q9CR59 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gadd45gip1Q9CR59 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gadd45gip1Q9CR59 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gadd45gip1Q9CR59 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gadd45gip1Q9CR59 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gadd45gip1Q9CR59 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gadd45gip1Q9CR59 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gadd45gip1Q9CR59 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Gadd45gip1Q9CR59 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gadd45gip1Q9CR59 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gadd45gip1Q9CR59 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gadd45gip1Q9CR59 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gadd45gip1Q9CR59 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gadd45gip1Q9CR59 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gadd45gip1Q9CR59 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gadd45gip1Q9CR59 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gadd45gip1Q9CR59 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gadd45gip1Q9CR59 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gadd45gip1Q9CR59 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gadd45gip1Q9CR59 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gadd45gip1Q9CR59 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gadd45gip1Q9CR59 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gadd45gip1Q9CR59 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gadd45gip1Q9CR59 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gadd45gip1Q9CR59 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gadd45gip1Q9CR59 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gadd45gip1Q9CR59 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gadd45gip1Q9CR59 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gadd45gip1Q9CR59 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gadd45gip1Q9CR59 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gadd45gip1Q9CR59 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gadd45gip1Q9CR59 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gadd45gip1Q9CR59 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 145 ms