Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQV4

Retreg3, Reticulophagy regulator 3, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Retreg3Q9CQV4 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retreg3Q9CQV4 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retreg3Q9CQV4 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retreg3Q9CQV4 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Retreg3Q9CQV4 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retreg3Q9CQV4 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retreg3Q9CQV4 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retreg3Q9CQV4 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retreg3Q9CQV4 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retreg3Q9CQV4 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retreg3Q9CQV4 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retreg3Q9CQV4 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retreg3Q9CQV4 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retreg3Q9CQV4 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retreg3Q9CQV4 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Retreg3Q9CQV4 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retreg3Q9CQV4 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retreg3Q9CQV4 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retreg3Q9CQV4 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retreg3Q9CQV4 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retreg3Q9CQV4 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retreg3Q9CQV4 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retreg3Q9CQV4 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retreg3Q9CQV4 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retreg3Q9CQV4 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retreg3Q9CQV4 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retreg3Q9CQV4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retreg3Q9CQV4 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retreg3Q9CQV4 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retreg3Q9CQV4 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retreg3Q9CQV4 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retreg3Q9CQV4 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retreg3Q9CQV4 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Retreg3Q9CQV4 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retreg3Q9CQV4 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retreg3Q9CQV4 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retreg3Q9CQV4 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retreg3Q9CQV4 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retreg3Q9CQV4 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retreg3Q9CQV4 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retreg3Q9CQV4 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retreg3Q9CQV4 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retreg3Q9CQV4 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retreg3Q9CQV4 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retreg3Q9CQV4 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retreg3Q9CQV4 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retreg3Q9CQV4 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retreg3Q9CQV4 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retreg3Q9CQV4 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retreg3Q9CQV4 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retreg3Q9CQV4 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retreg3Q9CQV4 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retreg3Q9CQV4 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retreg3Q9CQV4 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retreg3Q9CQV4 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retreg3Q9CQV4 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retreg3Q9CQV4 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retreg3Q9CQV4 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retreg3Q9CQV4 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retreg3Q9CQV4 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retreg3Q9CQV4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Retreg3Q9CQV4 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retreg3Q9CQV4 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retreg3Q9CQV4 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retreg3Q9CQV4 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retreg3Q9CQV4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retreg3Q9CQV4 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Retreg3Q9CQV4 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retreg3Q9CQV4 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Retreg3Q9CQV4 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retreg3Q9CQV4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retreg3Q9CQV4 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retreg3Q9CQV4 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retreg3Q9CQV4 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retreg3Q9CQV4 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retreg3Q9CQV4 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retreg3Q9CQV4 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retreg3Q9CQV4 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retreg3Q9CQV4 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retreg3Q9CQV4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retreg3Q9CQV4 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retreg3Q9CQV4 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retreg3Q9CQV4 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retreg3Q9CQV4 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retreg3Q9CQV4 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retreg3Q9CQV4 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retreg3Q9CQV4 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retreg3Q9CQV4 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retreg3Q9CQV4 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retreg3Q9CQV4 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retreg3Q9CQV4 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retreg3Q9CQV4 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retreg3Q9CQV4 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retreg3Q9CQV4 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retreg3Q9CQV4 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retreg3Q9CQV4 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retreg3Q9CQV4 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retreg3Q9CQV4 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retreg3Q9CQV4 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retreg3Q9CQV4 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms