Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM0

Nicn1, Nicolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nicn1Q9CQM0 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nicn1Q9CQM0 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nicn1Q9CQM0 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nicn1Q9CQM0 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nicn1Q9CQM0 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nicn1Q9CQM0 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nicn1Q9CQM0 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nicn1Q9CQM0 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nicn1Q9CQM0 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nicn1Q9CQM0 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nicn1Q9CQM0 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nicn1Q9CQM0 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nicn1Q9CQM0 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nicn1Q9CQM0 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nicn1Q9CQM0 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nicn1Q9CQM0 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nicn1Q9CQM0 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nicn1Q9CQM0 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Nicn1Q9CQM0 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Nicn1Q9CQM0 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nicn1Q9CQM0 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nicn1Q9CQM0 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nicn1Q9CQM0 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nicn1Q9CQM0 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nicn1Q9CQM0 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nicn1Q9CQM0 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nicn1Q9CQM0 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nicn1Q9CQM0 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nicn1Q9CQM0 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nicn1Q9CQM0 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nicn1Q9CQM0 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nicn1Q9CQM0 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nicn1Q9CQM0 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nicn1Q9CQM0 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nicn1Q9CQM0 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nicn1Q9CQM0 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nicn1Q9CQM0 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nicn1Q9CQM0 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nicn1Q9CQM0 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nicn1Q9CQM0 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nicn1Q9CQM0 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nicn1Q9CQM0 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nicn1Q9CQM0 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nicn1Q9CQM0 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Nicn1Q9CQM0 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nicn1Q9CQM0 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nicn1Q9CQM0 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nicn1Q9CQM0 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nicn1Q9CQM0 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nicn1Q9CQM0 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nicn1Q9CQM0 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nicn1Q9CQM0 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nicn1Q9CQM0 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nicn1Q9CQM0 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nicn1Q9CQM0 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nicn1Q9CQM0 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nicn1Q9CQM0 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nicn1Q9CQM0 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nicn1Q9CQM0 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nicn1Q9CQM0 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nicn1Q9CQM0 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nicn1Q9CQM0 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Nicn1Q9CQM0 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nicn1Q9CQM0 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nicn1Q9CQM0 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nicn1Q9CQM0 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nicn1Q9CQM0 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nicn1Q9CQM0 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nicn1Q9CQM0 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nicn1Q9CQM0 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nicn1Q9CQM0 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nicn1Q9CQM0 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nicn1Q9CQM0 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nicn1Q9CQM0 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Nicn1Q9CQM0 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nicn1Q9CQM0 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nicn1Q9CQM0 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nicn1Q9CQM0 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nicn1Q9CQM0 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nicn1Q9CQM0 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nicn1Q9CQM0 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nicn1Q9CQM0 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nicn1Q9CQM0 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nicn1Q9CQM0 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nicn1Q9CQM0 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nicn1Q9CQM0 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nicn1Q9CQM0 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nicn1Q9CQM0 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nicn1Q9CQM0 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Nicn1Q9CQM0 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nicn1Q9CQM0 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nicn1Q9CQM0 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nicn1Q9CQM0 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nicn1Q9CQM0 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nicn1Q9CQM0 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nicn1Q9CQM0 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nicn1Q9CQM0 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nicn1Q9CQM0 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nicn1Q9CQM0 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nicn1Q9CQM0 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms