Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD8

Atp6v0e1, V-type proton ATPase subunit e 1, mousemouse

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v0e1Q9CQD8 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atp6v0e1Q9CQD8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atp6v0e1Q9CQD8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atp6v0e1Q9CQD8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atp6v0e1Q9CQD8 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp6v0e1Q9CQD8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp6v0e1Q9CQD8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp6v0e1Q9CQD8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp6v0e1Q9CQD8 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp6v0e1Q9CQD8 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp6v0e1Q9CQD8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp6v0e1Q9CQD8 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp6v0e1Q9CQD8 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp6v0e1Q9CQD8 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp6v0e1Q9CQD8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp6v0e1Q9CQD8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp6v0e1Q9CQD8 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp6v0e1Q9CQD8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp6v0e1Q9CQD8 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp6v0e1Q9CQD8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp6v0e1Q9CQD8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp6v0e1Q9CQD8 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp6v0e1Q9CQD8 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp6v0e1Q9CQD8 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp6v0e1Q9CQD8 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp6v0e1Q9CQD8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp6v0e1Q9CQD8 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp6v0e1Q9CQD8 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp6v0e1Q9CQD8 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp6v0e1Q9CQD8 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp6v0e1Q9CQD8 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp6v0e1Q9CQD8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp6v0e1Q9CQD8 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atp6v0e1Q9CQD8 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atp6v0e1Q9CQD8 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atp6v0e1Q9CQD8 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atp6v0e1Q9CQD8 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atp6v0e1Q9CQD8 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Atp6v0e1Q9CQD8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Atp6v0e1Q9CQD8 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atp6v0e1Q9CQD8 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atp6v0e1Q9CQD8 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atp6v0e1Q9CQD8 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atp6v0e1Q9CQD8 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atp6v0e1Q9CQD8 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atp6v0e1Q9CQD8 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atp6v0e1Q9CQD8 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atp6v0e1Q9CQD8 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atp6v0e1Q9CQD8 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atp6v0e1Q9CQD8 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atp6v0e1Q9CQD8 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atp6v0e1Q9CQD8 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atp6v0e1Q9CQD8 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atp6v0e1Q9CQD8 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atp6v0e1Q9CQD8 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atp6v0e1Q9CQD8 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atp6v0e1Q9CQD8 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atp6v0e1Q9CQD8 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atp6v0e1Q9CQD8 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atp6v0e1Q9CQD8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atp6v0e1Q9CQD8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atp6v0e1Q9CQD8 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atp6v0e1Q9CQD8 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atp6v0e1Q9CQD8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atp6v0e1Q9CQD8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atp6v0e1Q9CQD8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atp6v0e1Q9CQD8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atp6v0e1Q9CQD8 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atp6v0e1Q9CQD8 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atp6v0e1Q9CQD8 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atp6v0e1Q9CQD8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp6v0e1Q9CQD8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp6v0e1Q9CQD8 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp6v0e1Q9CQD8 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp6v0e1Q9CQD8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp6v0e1Q9CQD8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp6v0e1Q9CQD8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp6v0e1Q9CQD8 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp6v0e1Q9CQD8 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp6v0e1Q9CQD8 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atp6v0e1Q9CQD8 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Atp6v0e1Q9CQD8 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atp6v0e1Q9CQD8 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp6v0e1Q9CQD8 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp6v0e1Q9CQD8 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp6v0e1Q9CQD8 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp6v0e1Q9CQD8 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp6v0e1Q9CQD8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp6v0e1Q9CQD8 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp6v0e1Q9CQD8 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
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