Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC3

Protein C9orf135 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQC3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Q9CQC3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Q9CQC3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Q9CQC3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Q9CQC3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Q9CQC3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Q9CQC3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Q9CQC3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Q9CQC3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Q9CQC3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Q9CQC3 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Q9CQC3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Q9CQC3 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Q9CQC3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Q9CQC3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Q9CQC3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Q9CQC3 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Q9CQC3 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Q9CQC3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Q9CQC3 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Q9CQC3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Q9CQC3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Q9CQC3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Q9CQC3 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Q9CQC3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Q9CQC3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Q9CQC3 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Q9CQC3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Q9CQC3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Q9CQC3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Q9CQC3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Q9CQC3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Q9CQC3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Q9CQC3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Q9CQC3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Q9CQC3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Q9CQC3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Q9CQC3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Q9CQC3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Q9CQC3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Q9CQC3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Q9CQC3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Q9CQC3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Q9CQC3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Q9CQC3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Q9CQC3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Q9CQC3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Q9CQC3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Q9CQC3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Q9CQC3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Q9CQC3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Q9CQC3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Q9CQC3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Q9CQC3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Q9CQC3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Q9CQC3 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Q9CQC3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Q9CQC3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Q9CQC3 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Q9CQC3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Q9CQC3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Q9CQC3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Q9CQC3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Q9CQC3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Q9CQC3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Q9CQC3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Q9CQC3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Q9CQC3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Q9CQC3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Q9CQC3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Q9CQC3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Q9CQC3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Q9CQC3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Q9CQC3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Q9CQC3 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Q9CQC3 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Q9CQC3 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Q9CQC3 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Q9CQC3 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Q9CQC3 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Q9CQC3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Q9CQC3 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Q9CQC3 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Q9CQC3 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Q9CQC3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Q9CQC3 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Q9CQC3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Q9CQC3 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Q9CQC3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Q9CQC3 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Q9CQC3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Q9CQC3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Q9CQC3 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Q9CQC3 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Q9CQC3 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Q9CQC3 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Q9CQC3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Q9CQC3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Q9CQC3 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Q9CQC3 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms