Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ18

Rnaseh2c, Ribonuclease H2 subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnaseh2cQ9CQ18 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rnaseh2cQ9CQ18 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnaseh2cQ9CQ18 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnaseh2cQ9CQ18 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnaseh2cQ9CQ18 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnaseh2cQ9CQ18 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnaseh2cQ9CQ18 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnaseh2cQ9CQ18 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnaseh2cQ9CQ18 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnaseh2cQ9CQ18 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnaseh2cQ9CQ18 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnaseh2cQ9CQ18 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnaseh2cQ9CQ18 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnaseh2cQ9CQ18 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnaseh2cQ9CQ18 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnaseh2cQ9CQ18 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnaseh2cQ9CQ18 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnaseh2cQ9CQ18 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnaseh2cQ9CQ18 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnaseh2cQ9CQ18 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnaseh2cQ9CQ18 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnaseh2cQ9CQ18 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnaseh2cQ9CQ18 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnaseh2cQ9CQ18 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnaseh2cQ9CQ18 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnaseh2cQ9CQ18 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnaseh2cQ9CQ18 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnaseh2cQ9CQ18 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnaseh2cQ9CQ18 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnaseh2cQ9CQ18 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnaseh2cQ9CQ18 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnaseh2cQ9CQ18 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnaseh2cQ9CQ18 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnaseh2cQ9CQ18 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnaseh2cQ9CQ18 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnaseh2cQ9CQ18 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnaseh2cQ9CQ18 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnaseh2cQ9CQ18 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Rnaseh2cQ9CQ18 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnaseh2cQ9CQ18 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnaseh2cQ9CQ18 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnaseh2cQ9CQ18 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnaseh2cQ9CQ18 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnaseh2cQ9CQ18 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnaseh2cQ9CQ18 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnaseh2cQ9CQ18 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnaseh2cQ9CQ18 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnaseh2cQ9CQ18 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnaseh2cQ9CQ18 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnaseh2cQ9CQ18 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnaseh2cQ9CQ18 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnaseh2cQ9CQ18 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnaseh2cQ9CQ18 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnaseh2cQ9CQ18 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnaseh2cQ9CQ18 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnaseh2cQ9CQ18 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnaseh2cQ9CQ18 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnaseh2cQ9CQ18 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnaseh2cQ9CQ18 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnaseh2cQ9CQ18 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnaseh2cQ9CQ18 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnaseh2cQ9CQ18 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnaseh2cQ9CQ18 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnaseh2cQ9CQ18 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnaseh2cQ9CQ18 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnaseh2cQ9CQ18 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnaseh2cQ9CQ18 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnaseh2cQ9CQ18 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnaseh2cQ9CQ18 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnaseh2cQ9CQ18 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnaseh2cQ9CQ18 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnaseh2cQ9CQ18 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnaseh2cQ9CQ18 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnaseh2cQ9CQ18 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnaseh2cQ9CQ18 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnaseh2cQ9CQ18 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnaseh2cQ9CQ18 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnaseh2cQ9CQ18 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnaseh2cQ9CQ18 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms