Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ07

Lrrc18, Leucine-rich repeat-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc18Q9CQ07 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lrrc18Q9CQ07 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lrrc18Q9CQ07 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lrrc18Q9CQ07 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lrrc18Q9CQ07 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lrrc18Q9CQ07 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lrrc18Q9CQ07 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lrrc18Q9CQ07 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lrrc18Q9CQ07 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lrrc18Q9CQ07 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Lrrc18Q9CQ07 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Lrrc18Q9CQ07 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Lrrc18Q9CQ07 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lrrc18Q9CQ07 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lrrc18Q9CQ07 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lrrc18Q9CQ07 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lrrc18Q9CQ07 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lrrc18Q9CQ07 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Lrrc18Q9CQ07 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lrrc18Q9CQ07 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lrrc18Q9CQ07 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lrrc18Q9CQ07 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lrrc18Q9CQ07 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lrrc18Q9CQ07 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lrrc18Q9CQ07 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lrrc18Q9CQ07 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lrrc18Q9CQ07 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lrrc18Q9CQ07 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lrrc18Q9CQ07 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lrrc18Q9CQ07 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lrrc18Q9CQ07 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lrrc18Q9CQ07 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lrrc18Q9CQ07 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lrrc18Q9CQ07 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lrrc18Q9CQ07 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lrrc18Q9CQ07 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lrrc18Q9CQ07 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Lrrc18Q9CQ07 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lrrc18Q9CQ07 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lrrc18Q9CQ07 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lrrc18Q9CQ07 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lrrc18Q9CQ07 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lrrc18Q9CQ07 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lrrc18Q9CQ07 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lrrc18Q9CQ07 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Lrrc18Q9CQ07 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Lrrc18Q9CQ07 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lrrc18Q9CQ07 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Lrrc18Q9CQ07 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lrrc18Q9CQ07 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lrrc18Q9CQ07 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lrrc18Q9CQ07 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lrrc18Q9CQ07 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lrrc18Q9CQ07 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lrrc18Q9CQ07 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Lrrc18Q9CQ07 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lrrc18Q9CQ07 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lrrc18Q9CQ07 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lrrc18Q9CQ07 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lrrc18Q9CQ07 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lrrc18Q9CQ07 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lrrc18Q9CQ07 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lrrc18Q9CQ07 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lrrc18Q9CQ07 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lrrc18Q9CQ07 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lrrc18Q9CQ07 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lrrc18Q9CQ07 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lrrc18Q9CQ07 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lrrc18Q9CQ07 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lrrc18Q9CQ07 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lrrc18Q9CQ07 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lrrc18Q9CQ07 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lrrc18Q9CQ07 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lrrc18Q9CQ07 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Lrrc18Q9CQ07 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrrc18Q9CQ07 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrrc18Q9CQ07 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrrc18Q9CQ07 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrrc18Q9CQ07 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrrc18Q9CQ07 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrrc18Q9CQ07 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrrc18Q9CQ07 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrrc18Q9CQ07 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrrc18Q9CQ07 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrrc18Q9CQ07 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrrc18Q9CQ07 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrrc18Q9CQ07 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lrrc18Q9CQ07 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lrrc18Q9CQ07 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lrrc18Q9CQ07 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lrrc18Q9CQ07 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lrrc18Q9CQ07 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lrrc18Q9CQ07 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Lrrc18Q9CQ07 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lrrc18Q9CQ07 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrrc18Q9CQ07 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrrc18Q9CQ07 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrrc18Q9CQ07 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrrc18Q9CQ07 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrrc18Q9CQ07 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.7 ms