Protein–RNA interactions for Protein: Q99PT3

Ino80b, INO80 complex subunit B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80bQ99PT3 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ino80bQ99PT3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ino80bQ99PT3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ino80bQ99PT3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ino80bQ99PT3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ino80bQ99PT3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ino80bQ99PT3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ino80bQ99PT3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ino80bQ99PT3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ino80bQ99PT3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ino80bQ99PT3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ino80bQ99PT3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ino80bQ99PT3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ino80bQ99PT3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ino80bQ99PT3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ino80bQ99PT3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ino80bQ99PT3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ino80bQ99PT3 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ino80bQ99PT3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Ino80bQ99PT3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ino80bQ99PT3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ino80bQ99PT3 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ino80bQ99PT3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ino80bQ99PT3 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ino80bQ99PT3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ino80bQ99PT3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ino80bQ99PT3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ino80bQ99PT3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ino80bQ99PT3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ino80bQ99PT3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ino80bQ99PT3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ino80bQ99PT3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ino80bQ99PT3 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ino80bQ99PT3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ino80bQ99PT3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Ino80bQ99PT3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ino80bQ99PT3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ino80bQ99PT3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ino80bQ99PT3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ino80bQ99PT3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ino80bQ99PT3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ino80bQ99PT3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ino80bQ99PT3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ino80bQ99PT3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ino80bQ99PT3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ino80bQ99PT3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ino80bQ99PT3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ino80bQ99PT3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ino80bQ99PT3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ino80bQ99PT3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ino80bQ99PT3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ino80bQ99PT3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ino80bQ99PT3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ino80bQ99PT3 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ino80bQ99PT3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ino80bQ99PT3 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ino80bQ99PT3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ino80bQ99PT3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ino80bQ99PT3 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ino80bQ99PT3 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ino80bQ99PT3 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ino80bQ99PT3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ino80bQ99PT3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ino80bQ99PT3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Ino80bQ99PT3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ino80bQ99PT3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ino80bQ99PT3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ino80bQ99PT3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ino80bQ99PT3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ino80bQ99PT3 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ino80bQ99PT3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ino80bQ99PT3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ino80bQ99PT3 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ino80bQ99PT3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ino80bQ99PT3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Ino80bQ99PT3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ino80bQ99PT3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ino80bQ99PT3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ino80bQ99PT3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ino80bQ99PT3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ino80bQ99PT3 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Ino80bQ99PT3 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ino80bQ99PT3 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ino80bQ99PT3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ino80bQ99PT3 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ino80bQ99PT3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ino80bQ99PT3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ino80bQ99PT3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ino80bQ99PT3 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ino80bQ99PT3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ino80bQ99PT3 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Ino80bQ99PT3 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ino80bQ99PT3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ino80bQ99PT3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ino80bQ99PT3 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ino80bQ99PT3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ino80bQ99PT3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ino80bQ99PT3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ino80bQ99PT3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ino80bQ99PT3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms