Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL6

Ubxn6, UBX domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn6Q99PL6 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ubxn6Q99PL6 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ubxn6Q99PL6 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ubxn6Q99PL6 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Ubxn6Q99PL6 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ubxn6Q99PL6 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ubxn6Q99PL6 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ubxn6Q99PL6 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ubxn6Q99PL6 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ubxn6Q99PL6 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ubxn6Q99PL6 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Ubxn6Q99PL6 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ubxn6Q99PL6 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ubxn6Q99PL6 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ubxn6Q99PL6 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Ubxn6Q99PL6 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ubxn6Q99PL6 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ubxn6Q99PL6 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ubxn6Q99PL6 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.27
Ubxn6Q99PL6 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ubxn6Q99PL6 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ubxn6Q99PL6 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ubxn6Q99PL6 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
Ubxn6Q99PL6 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Ubxn6Q99PL6 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ubxn6Q99PL6 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23■■□□□ 1.27
Ubxn6Q99PL6 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ubxn6Q99PL6 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23■■□□□ 1.27
Ubxn6Q99PL6 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ubxn6Q99PL6 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ubxn6Q99PL6 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ubxn6Q99PL6 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ubxn6Q99PL6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ubxn6Q99PL6 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ubxn6Q99PL6 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Ubxn6Q99PL6 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ubxn6Q99PL6 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Ubxn6Q99PL6 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ubxn6Q99PL6 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ubxn6Q99PL6 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ubxn6Q99PL6 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ubxn6Q99PL6 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ubxn6Q99PL6 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Ubxn6Q99PL6 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ubxn6Q99PL6 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Ubxn6Q99PL6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ubxn6Q99PL6 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ubxn6Q99PL6 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ubxn6Q99PL6 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Ubxn6Q99PL6 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ubxn6Q99PL6 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ubxn6Q99PL6 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ubxn6Q99PL6 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ubxn6Q99PL6 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ubxn6Q99PL6 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ubxn6Q99PL6 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ubxn6Q99PL6 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Ubxn6Q99PL6 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ubxn6Q99PL6 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ubxn6Q99PL6 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ubxn6Q99PL6 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ubxn6Q99PL6 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ubxn6Q99PL6 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ubxn6Q99PL6 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ubxn6Q99PL6 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ubxn6Q99PL6 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ubxn6Q99PL6 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ubxn6Q99PL6 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ubxn6Q99PL6 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ubxn6Q99PL6 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ubxn6Q99PL6 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ubxn6Q99PL6 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ubxn6Q99PL6 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ubxn6Q99PL6 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ubxn6Q99PL6 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ubxn6Q99PL6 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ubxn6Q99PL6 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ubxn6Q99PL6 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Ubxn6Q99PL6 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ubxn6Q99PL6 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ubxn6Q99PL6 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ubxn6Q99PL6 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ubxn6Q99PL6 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ubxn6Q99PL6 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ubxn6Q99PL6 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ubxn6Q99PL6 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ubxn6Q99PL6 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ubxn6Q99PL6 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ubxn6Q99PL6 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ubxn6Q99PL6 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ubxn6Q99PL6 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ubxn6Q99PL6 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Ubxn6Q99PL6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ubxn6Q99PL6 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ubxn6Q99PL6 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ubxn6Q99PL6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ubxn6Q99PL6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ubxn6Q99PL6 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ubxn6Q99PL6 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ubxn6Q99PL6 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms