Protein–RNA interactions for Protein: Q99P72

Rtn4, Reticulon-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtn4Q99P72 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rtn4Q99P72 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rtn4Q99P72 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rtn4Q99P72 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rtn4Q99P72 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Rtn4Q99P72 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rtn4Q99P72 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Rtn4Q99P72 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rtn4Q99P72 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rtn4Q99P72 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rtn4Q99P72 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rtn4Q99P72 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rtn4Q99P72 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rtn4Q99P72 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rtn4Q99P72 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rtn4Q99P72 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rtn4Q99P72 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rtn4Q99P72 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rtn4Q99P72 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rtn4Q99P72 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rtn4Q99P72 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Rtn4Q99P72 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Rtn4Q99P72 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Rtn4Q99P72 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Rtn4Q99P72 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Rtn4Q99P72 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Rtn4Q99P72 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Rtn4Q99P72 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Rtn4Q99P72 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Rtn4Q99P72 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Rtn4Q99P72 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Rtn4Q99P72 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Rtn4Q99P72 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rtn4Q99P72 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rtn4Q99P72 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rtn4Q99P72 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rtn4Q99P72 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rtn4Q99P72 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rtn4Q99P72 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rtn4Q99P72 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rtn4Q99P72 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rtn4Q99P72 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rtn4Q99P72 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rtn4Q99P72 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rtn4Q99P72 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rtn4Q99P72 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rtn4Q99P72 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rtn4Q99P72 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rtn4Q99P72 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rtn4Q99P72 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rtn4Q99P72 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rtn4Q99P72 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rtn4Q99P72 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rtn4Q99P72 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rtn4Q99P72 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rtn4Q99P72 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rtn4Q99P72 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Rtn4Q99P72 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Rtn4Q99P72 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Rtn4Q99P72 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Rtn4Q99P72 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Rtn4Q99P72 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Rtn4Q99P72 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Rtn4Q99P72 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Rtn4Q99P72 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Rtn4Q99P72 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Rtn4Q99P72 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rtn4Q99P72 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rtn4Q99P72 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rtn4Q99P72 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rtn4Q99P72 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rtn4Q99P72 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rtn4Q99P72 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rtn4Q99P72 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rtn4Q99P72 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rtn4Q99P72 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rtn4Q99P72 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rtn4Q99P72 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rtn4Q99P72 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rtn4Q99P72 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rtn4Q99P72 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rtn4Q99P72 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Rtn4Q99P72 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rtn4Q99P72 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rtn4Q99P72 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rtn4Q99P72 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rtn4Q99P72 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rtn4Q99P72 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rtn4Q99P72 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rtn4Q99P72 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rtn4Q99P72 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rtn4Q99P72 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rtn4Q99P72 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rtn4Q99P72 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rtn4Q99P72 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rtn4Q99P72 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rtn4Q99P72 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rtn4Q99P72 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rtn4Q99P72 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rtn4Q99P72 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 116.3 ms