Protein–RNA interactions for Protein: Q99N20

Brms1, Breast cancer metastasis-suppressor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brms1Q99N20 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Brms1Q99N20 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Brms1Q99N20 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Brms1Q99N20 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Brms1Q99N20 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Brms1Q99N20 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Brms1Q99N20 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Brms1Q99N20 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Brms1Q99N20 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Brms1Q99N20 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Brms1Q99N20 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Brms1Q99N20 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Brms1Q99N20 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Brms1Q99N20 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Brms1Q99N20 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Brms1Q99N20 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Brms1Q99N20 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Brms1Q99N20 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Brms1Q99N20 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Brms1Q99N20 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Brms1Q99N20 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Brms1Q99N20 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Brms1Q99N20 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Brms1Q99N20 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Brms1Q99N20 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Brms1Q99N20 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Brms1Q99N20 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Brms1Q99N20 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Brms1Q99N20 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Brms1Q99N20 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Brms1Q99N20 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Brms1Q99N20 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Brms1Q99N20 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Brms1Q99N20 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Brms1Q99N20 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Brms1Q99N20 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Brms1Q99N20 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Brms1Q99N20 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Brms1Q99N20 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Brms1Q99N20 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Brms1Q99N20 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Brms1Q99N20 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Brms1Q99N20 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Brms1Q99N20 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Brms1Q99N20 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Brms1Q99N20 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Brms1Q99N20 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Brms1Q99N20 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Brms1Q99N20 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Brms1Q99N20 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Brms1Q99N20 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Brms1Q99N20 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Brms1Q99N20 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Brms1Q99N20 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Brms1Q99N20 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Brms1Q99N20 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Brms1Q99N20 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Brms1Q99N20 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Brms1Q99N20 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Brms1Q99N20 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Brms1Q99N20 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Brms1Q99N20 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Brms1Q99N20 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Brms1Q99N20 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Brms1Q99N20 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Brms1Q99N20 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Brms1Q99N20 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Brms1Q99N20 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Brms1Q99N20 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Brms1Q99N20 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Brms1Q99N20 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Brms1Q99N20 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Brms1Q99N20 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Brms1Q99N20 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Brms1Q99N20 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Brms1Q99N20 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Brms1Q99N20 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Brms1Q99N20 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Brms1Q99N20 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Brms1Q99N20 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Brms1Q99N20 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Brms1Q99N20 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Brms1Q99N20 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Brms1Q99N20 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Brms1Q99N20 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Brms1Q99N20 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Brms1Q99N20 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Brms1Q99N20 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Brms1Q99N20 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Brms1Q99N20 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Brms1Q99N20 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Brms1Q99N20 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Brms1Q99N20 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Brms1Q99N20 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Brms1Q99N20 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Brms1Q99N20 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Brms1Q99N20 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Brms1Q99N20 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Brms1Q99N20 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Brms1Q99N20 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms