Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME9

Gtpbp4, Nucleolar GTP-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp4Q99ME9 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gtpbp4Q99ME9 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gtpbp4Q99ME9 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gtpbp4Q99ME9 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gtpbp4Q99ME9 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gtpbp4Q99ME9 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gtpbp4Q99ME9 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gtpbp4Q99ME9 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gtpbp4Q99ME9 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gtpbp4Q99ME9 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gtpbp4Q99ME9 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gtpbp4Q99ME9 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Gtpbp4Q99ME9 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Gtpbp4Q99ME9 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gtpbp4Q99ME9 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gtpbp4Q99ME9 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gtpbp4Q99ME9 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gtpbp4Q99ME9 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gtpbp4Q99ME9 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Gtpbp4Q99ME9 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gtpbp4Q99ME9 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gtpbp4Q99ME9 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gtpbp4Q99ME9 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gtpbp4Q99ME9 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Gtpbp4Q99ME9 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gtpbp4Q99ME9 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gtpbp4Q99ME9 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gtpbp4Q99ME9 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gtpbp4Q99ME9 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gtpbp4Q99ME9 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gtpbp4Q99ME9 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Gtpbp4Q99ME9 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Gtpbp4Q99ME9 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gtpbp4Q99ME9 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gtpbp4Q99ME9 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gtpbp4Q99ME9 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gtpbp4Q99ME9 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Gtpbp4Q99ME9 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gtpbp4Q99ME9 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gtpbp4Q99ME9 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gtpbp4Q99ME9 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gtpbp4Q99ME9 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gtpbp4Q99ME9 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gtpbp4Q99ME9 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gtpbp4Q99ME9 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gtpbp4Q99ME9 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gtpbp4Q99ME9 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gtpbp4Q99ME9 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gtpbp4Q99ME9 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gtpbp4Q99ME9 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gtpbp4Q99ME9 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gtpbp4Q99ME9 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gtpbp4Q99ME9 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gtpbp4Q99ME9 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gtpbp4Q99ME9 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Gtpbp4Q99ME9 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gtpbp4Q99ME9 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gtpbp4Q99ME9 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gtpbp4Q99ME9 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gtpbp4Q99ME9 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gtpbp4Q99ME9 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gtpbp4Q99ME9 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gtpbp4Q99ME9 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gtpbp4Q99ME9 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gtpbp4Q99ME9 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gtpbp4Q99ME9 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gtpbp4Q99ME9 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gtpbp4Q99ME9 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gtpbp4Q99ME9 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gtpbp4Q99ME9 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gtpbp4Q99ME9 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gtpbp4Q99ME9 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gtpbp4Q99ME9 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Gtpbp4Q99ME9 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gtpbp4Q99ME9 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Gtpbp4Q99ME9 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gtpbp4Q99ME9 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gtpbp4Q99ME9 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gtpbp4Q99ME9 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gtpbp4Q99ME9 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gtpbp4Q99ME9 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Gtpbp4Q99ME9 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Gtpbp4Q99ME9 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gtpbp4Q99ME9 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gtpbp4Q99ME9 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gtpbp4Q99ME9 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gtpbp4Q99ME9 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gtpbp4Q99ME9 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gtpbp4Q99ME9 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gtpbp4Q99ME9 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gtpbp4Q99ME9 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gtpbp4Q99ME9 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gtpbp4Q99ME9 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gtpbp4Q99ME9 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gtpbp4Q99ME9 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Gtpbp4Q99ME9 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gtpbp4Q99ME9 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gtpbp4Q99ME9 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gtpbp4Q99ME9 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gtpbp4Q99ME9 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.7 ms