Protein–RNA interactions for Protein: Q99MB3

Tm2d1, TM2 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm2d1Q99MB3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tm2d1Q99MB3 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tm2d1Q99MB3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tm2d1Q99MB3 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tm2d1Q99MB3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tm2d1Q99MB3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tm2d1Q99MB3 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tm2d1Q99MB3 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tm2d1Q99MB3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tm2d1Q99MB3 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tm2d1Q99MB3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tm2d1Q99MB3 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tm2d1Q99MB3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tm2d1Q99MB3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tm2d1Q99MB3 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tm2d1Q99MB3 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tm2d1Q99MB3 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tm2d1Q99MB3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tm2d1Q99MB3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tm2d1Q99MB3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tm2d1Q99MB3 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tm2d1Q99MB3 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tm2d1Q99MB3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Tm2d1Q99MB3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tm2d1Q99MB3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tm2d1Q99MB3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tm2d1Q99MB3 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tm2d1Q99MB3 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tm2d1Q99MB3 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tm2d1Q99MB3 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tm2d1Q99MB3 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tm2d1Q99MB3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tm2d1Q99MB3 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tm2d1Q99MB3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tm2d1Q99MB3 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Tm2d1Q99MB3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tm2d1Q99MB3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tm2d1Q99MB3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tm2d1Q99MB3 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Tm2d1Q99MB3 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tm2d1Q99MB3 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tm2d1Q99MB3 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tm2d1Q99MB3 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tm2d1Q99MB3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tm2d1Q99MB3 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tm2d1Q99MB3 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tm2d1Q99MB3 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tm2d1Q99MB3 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tm2d1Q99MB3 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tm2d1Q99MB3 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tm2d1Q99MB3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tm2d1Q99MB3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tm2d1Q99MB3 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tm2d1Q99MB3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tm2d1Q99MB3 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tm2d1Q99MB3 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tm2d1Q99MB3 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Tm2d1Q99MB3 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Tm2d1Q99MB3 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tm2d1Q99MB3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tm2d1Q99MB3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tm2d1Q99MB3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tm2d1Q99MB3 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tm2d1Q99MB3 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tm2d1Q99MB3 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tm2d1Q99MB3 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tm2d1Q99MB3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tm2d1Q99MB3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tm2d1Q99MB3 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Tm2d1Q99MB3 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tm2d1Q99MB3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tm2d1Q99MB3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tm2d1Q99MB3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tm2d1Q99MB3 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tm2d1Q99MB3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tm2d1Q99MB3 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tm2d1Q99MB3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tm2d1Q99MB3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tm2d1Q99MB3 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tm2d1Q99MB3 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tm2d1Q99MB3 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tm2d1Q99MB3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tm2d1Q99MB3 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tm2d1Q99MB3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tm2d1Q99MB3 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tm2d1Q99MB3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tm2d1Q99MB3 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tm2d1Q99MB3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tm2d1Q99MB3 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tm2d1Q99MB3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tm2d1Q99MB3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tm2d1Q99MB3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tm2d1Q99MB3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tm2d1Q99MB3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tm2d1Q99MB3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tm2d1Q99MB3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tm2d1Q99MB3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tm2d1Q99MB3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tm2d1Q99MB3 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tm2d1Q99MB3 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms