Protein–RNA interactions for Protein: Q99LF4

Rtcb, tRNA-splicing ligase RtcB homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RtcbQ99LF4 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
RtcbQ99LF4 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RtcbQ99LF4 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RtcbQ99LF4 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RtcbQ99LF4 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RtcbQ99LF4 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RtcbQ99LF4 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RtcbQ99LF4 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RtcbQ99LF4 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RtcbQ99LF4 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RtcbQ99LF4 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RtcbQ99LF4 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RtcbQ99LF4 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RtcbQ99LF4 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RtcbQ99LF4 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RtcbQ99LF4 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RtcbQ99LF4 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RtcbQ99LF4 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
RtcbQ99LF4 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RtcbQ99LF4 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RtcbQ99LF4 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RtcbQ99LF4 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RtcbQ99LF4 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RtcbQ99LF4 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
RtcbQ99LF4 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
RtcbQ99LF4 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RtcbQ99LF4 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RtcbQ99LF4 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RtcbQ99LF4 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RtcbQ99LF4 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RtcbQ99LF4 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RtcbQ99LF4 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
RtcbQ99LF4 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
RtcbQ99LF4 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RtcbQ99LF4 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RtcbQ99LF4 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RtcbQ99LF4 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RtcbQ99LF4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RtcbQ99LF4 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RtcbQ99LF4 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RtcbQ99LF4 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RtcbQ99LF4 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RtcbQ99LF4 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RtcbQ99LF4 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RtcbQ99LF4 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
RtcbQ99LF4 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
RtcbQ99LF4 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RtcbQ99LF4 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RtcbQ99LF4 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RtcbQ99LF4 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC27.57■■■□□ 2
RtcbQ99LF4 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RtcbQ99LF4 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RtcbQ99LF4 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC27.56■■■□□ 2
RtcbQ99LF4 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RtcbQ99LF4 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RtcbQ99LF4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RtcbQ99LF4 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
RtcbQ99LF4 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RtcbQ99LF4 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RtcbQ99LF4 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.55■■■□□ 2
RtcbQ99LF4 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RtcbQ99LF4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
RtcbQ99LF4 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RtcbQ99LF4 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RtcbQ99LF4 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RtcbQ99LF4 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
RtcbQ99LF4 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RtcbQ99LF4 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
RtcbQ99LF4 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RtcbQ99LF4 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RtcbQ99LF4 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
RtcbQ99LF4 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RtcbQ99LF4 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
RtcbQ99LF4 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
RtcbQ99LF4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RtcbQ99LF4 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
RtcbQ99LF4 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RtcbQ99LF4 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RtcbQ99LF4 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RtcbQ99LF4 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RtcbQ99LF4 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
RtcbQ99LF4 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
RtcbQ99LF4 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RtcbQ99LF4 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RtcbQ99LF4 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RtcbQ99LF4 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RtcbQ99LF4 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RtcbQ99LF4 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RtcbQ99LF4 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RtcbQ99LF4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RtcbQ99LF4 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RtcbQ99LF4 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RtcbQ99LF4 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RtcbQ99LF4 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RtcbQ99LF4 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RtcbQ99LF4 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RtcbQ99LF4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
RtcbQ99LF4 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
RtcbQ99LF4 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
RtcbQ99LF4 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.2 ms