Protein–RNA interactions for Protein: Q99KK1

Reep3, Receptor expression-enhancing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reep3Q99KK1 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Reep3Q99KK1 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Reep3Q99KK1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Reep3Q99KK1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Reep3Q99KK1 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Reep3Q99KK1 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Reep3Q99KK1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Reep3Q99KK1 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Reep3Q99KK1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Reep3Q99KK1 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Reep3Q99KK1 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Reep3Q99KK1 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Reep3Q99KK1 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Reep3Q99KK1 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Reep3Q99KK1 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Reep3Q99KK1 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Reep3Q99KK1 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Reep3Q99KK1 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Reep3Q99KK1 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Reep3Q99KK1 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Reep3Q99KK1 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Reep3Q99KK1 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Reep3Q99KK1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Reep3Q99KK1 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Reep3Q99KK1 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Reep3Q99KK1 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Reep3Q99KK1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Reep3Q99KK1 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Reep3Q99KK1 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Reep3Q99KK1 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Reep3Q99KK1 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Reep3Q99KK1 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Reep3Q99KK1 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Reep3Q99KK1 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Reep3Q99KK1 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Reep3Q99KK1 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Reep3Q99KK1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Reep3Q99KK1 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Reep3Q99KK1 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Reep3Q99KK1 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Reep3Q99KK1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Reep3Q99KK1 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Reep3Q99KK1 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Reep3Q99KK1 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Reep3Q99KK1 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Reep3Q99KK1 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Reep3Q99KK1 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Reep3Q99KK1 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Reep3Q99KK1 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Reep3Q99KK1 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Reep3Q99KK1 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Reep3Q99KK1 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Reep3Q99KK1 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Reep3Q99KK1 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Reep3Q99KK1 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Reep3Q99KK1 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Reep3Q99KK1 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Reep3Q99KK1 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Reep3Q99KK1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Reep3Q99KK1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Reep3Q99KK1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Reep3Q99KK1 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Reep3Q99KK1 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Reep3Q99KK1 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Reep3Q99KK1 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Reep3Q99KK1 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Reep3Q99KK1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Reep3Q99KK1 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Reep3Q99KK1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Reep3Q99KK1 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Reep3Q99KK1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Reep3Q99KK1 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Reep3Q99KK1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Reep3Q99KK1 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Reep3Q99KK1 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Reep3Q99KK1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Reep3Q99KK1 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Reep3Q99KK1 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Reep3Q99KK1 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Reep3Q99KK1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Reep3Q99KK1 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Reep3Q99KK1 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Reep3Q99KK1 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Reep3Q99KK1 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Reep3Q99KK1 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Reep3Q99KK1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Reep3Q99KK1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Reep3Q99KK1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Reep3Q99KK1 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Reep3Q99KK1 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Reep3Q99KK1 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Reep3Q99KK1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Reep3Q99KK1 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Reep3Q99KK1 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Reep3Q99KK1 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Reep3Q99KK1 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Reep3Q99KK1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Reep3Q99KK1 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Reep3Q99KK1 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Reep3Q99KK1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms