Protein–RNA interactions for Protein: Q99JS0

Ncmap, Noncompact myelin-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcmapQ99JS0 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NcmapQ99JS0 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NcmapQ99JS0 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NcmapQ99JS0 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NcmapQ99JS0 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NcmapQ99JS0 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NcmapQ99JS0 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NcmapQ99JS0 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NcmapQ99JS0 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NcmapQ99JS0 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NcmapQ99JS0 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NcmapQ99JS0 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NcmapQ99JS0 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NcmapQ99JS0 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NcmapQ99JS0 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NcmapQ99JS0 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NcmapQ99JS0 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NcmapQ99JS0 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NcmapQ99JS0 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NcmapQ99JS0 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NcmapQ99JS0 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NcmapQ99JS0 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NcmapQ99JS0 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NcmapQ99JS0 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NcmapQ99JS0 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NcmapQ99JS0 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NcmapQ99JS0 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NcmapQ99JS0 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NcmapQ99JS0 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NcmapQ99JS0 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NcmapQ99JS0 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NcmapQ99JS0 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NcmapQ99JS0 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NcmapQ99JS0 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NcmapQ99JS0 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NcmapQ99JS0 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NcmapQ99JS0 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NcmapQ99JS0 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NcmapQ99JS0 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
NcmapQ99JS0 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NcmapQ99JS0 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NcmapQ99JS0 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NcmapQ99JS0 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NcmapQ99JS0 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NcmapQ99JS0 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NcmapQ99JS0 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NcmapQ99JS0 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NcmapQ99JS0 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NcmapQ99JS0 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NcmapQ99JS0 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NcmapQ99JS0 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NcmapQ99JS0 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NcmapQ99JS0 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NcmapQ99JS0 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NcmapQ99JS0 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NcmapQ99JS0 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NcmapQ99JS0 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NcmapQ99JS0 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
NcmapQ99JS0 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NcmapQ99JS0 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NcmapQ99JS0 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NcmapQ99JS0 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NcmapQ99JS0 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NcmapQ99JS0 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NcmapQ99JS0 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NcmapQ99JS0 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NcmapQ99JS0 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NcmapQ99JS0 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NcmapQ99JS0 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NcmapQ99JS0 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NcmapQ99JS0 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NcmapQ99JS0 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NcmapQ99JS0 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NcmapQ99JS0 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NcmapQ99JS0 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NcmapQ99JS0 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NcmapQ99JS0 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NcmapQ99JS0 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NcmapQ99JS0 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
NcmapQ99JS0 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NcmapQ99JS0 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NcmapQ99JS0 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NcmapQ99JS0 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NcmapQ99JS0 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NcmapQ99JS0 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NcmapQ99JS0 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NcmapQ99JS0 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NcmapQ99JS0 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
NcmapQ99JS0 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
NcmapQ99JS0 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NcmapQ99JS0 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NcmapQ99JS0 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NcmapQ99JS0 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NcmapQ99JS0 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NcmapQ99JS0 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NcmapQ99JS0 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NcmapQ99JS0 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NcmapQ99JS0 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NcmapQ99JS0 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NcmapQ99JS0 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms