Protein–RNA interactions for Protein: Q91Z38

Ttc1, Tetratricopeptide repeat protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc1Q91Z38 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ttc1Q91Z38 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ttc1Q91Z38 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ttc1Q91Z38 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Ttc1Q91Z38 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ttc1Q91Z38 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ttc1Q91Z38 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ttc1Q91Z38 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ttc1Q91Z38 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ttc1Q91Z38 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ttc1Q91Z38 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Ttc1Q91Z38 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ttc1Q91Z38 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ttc1Q91Z38 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ttc1Q91Z38 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ttc1Q91Z38 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ttc1Q91Z38 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ttc1Q91Z38 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ttc1Q91Z38 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ttc1Q91Z38 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ttc1Q91Z38 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ttc1Q91Z38 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ttc1Q91Z38 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ttc1Q91Z38 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ttc1Q91Z38 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ttc1Q91Z38 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ttc1Q91Z38 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ttc1Q91Z38 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Ttc1Q91Z38 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ttc1Q91Z38 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ttc1Q91Z38 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Ttc1Q91Z38 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ttc1Q91Z38 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ttc1Q91Z38 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ttc1Q91Z38 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ttc1Q91Z38 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ttc1Q91Z38 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ttc1Q91Z38 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ttc1Q91Z38 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ttc1Q91Z38 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ttc1Q91Z38 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ttc1Q91Z38 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ttc1Q91Z38 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ttc1Q91Z38 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ttc1Q91Z38 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ttc1Q91Z38 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ttc1Q91Z38 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ttc1Q91Z38 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ttc1Q91Z38 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ttc1Q91Z38 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ttc1Q91Z38 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ttc1Q91Z38 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ttc1Q91Z38 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ttc1Q91Z38 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ttc1Q91Z38 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ttc1Q91Z38 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ttc1Q91Z38 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ttc1Q91Z38 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ttc1Q91Z38 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ttc1Q91Z38 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ttc1Q91Z38 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ttc1Q91Z38 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ttc1Q91Z38 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ttc1Q91Z38 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ttc1Q91Z38 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ttc1Q91Z38 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ttc1Q91Z38 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ttc1Q91Z38 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ttc1Q91Z38 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ttc1Q91Z38 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ttc1Q91Z38 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ttc1Q91Z38 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ttc1Q91Z38 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ttc1Q91Z38 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ttc1Q91Z38 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ttc1Q91Z38 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Ttc1Q91Z38 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ttc1Q91Z38 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ttc1Q91Z38 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ttc1Q91Z38 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ttc1Q91Z38 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ttc1Q91Z38 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ttc1Q91Z38 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ttc1Q91Z38 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Ttc1Q91Z38 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ttc1Q91Z38 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ttc1Q91Z38 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ttc1Q91Z38 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ttc1Q91Z38 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ttc1Q91Z38 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ttc1Q91Z38 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ttc1Q91Z38 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ttc1Q91Z38 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ttc1Q91Z38 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ttc1Q91Z38 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ttc1Q91Z38 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ttc1Q91Z38 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ttc1Q91Z38 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ttc1Q91Z38 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ttc1Q91Z38 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms