Protein–RNA interactions for Protein: Q91X60

Chrna2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna2Q91X60 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Chrna2Q91X60 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Chrna2Q91X60 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Chrna2Q91X60 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Chrna2Q91X60 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Chrna2Q91X60 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Chrna2Q91X60 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Chrna2Q91X60 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Chrna2Q91X60 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Chrna2Q91X60 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Chrna2Q91X60 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Chrna2Q91X60 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Chrna2Q91X60 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Chrna2Q91X60 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Chrna2Q91X60 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Chrna2Q91X60 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Chrna2Q91X60 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Chrna2Q91X60 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Chrna2Q91X60 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Chrna2Q91X60 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Chrna2Q91X60 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Chrna2Q91X60 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Chrna2Q91X60 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Chrna2Q91X60 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Chrna2Q91X60 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Chrna2Q91X60 Ccl25-201ENSMUST00000024004 1058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Chrna2Q91X60 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Chrna2Q91X60 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Chrna2Q91X60 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Chrna2Q91X60 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Chrna2Q91X60 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Chrna2Q91X60 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Chrna2Q91X60 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Chrna2Q91X60 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Chrna2Q91X60 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Chrna2Q91X60 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Chrna2Q91X60 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Chrna2Q91X60 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Chrna2Q91X60 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Chrna2Q91X60 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Chrna2Q91X60 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Chrna2Q91X60 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Chrna2Q91X60 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Chrna2Q91X60 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Chrna2Q91X60 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Chrna2Q91X60 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Chrna2Q91X60 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Chrna2Q91X60 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Chrna2Q91X60 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Chrna2Q91X60 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Chrna2Q91X60 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Chrna2Q91X60 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Chrna2Q91X60 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Chrna2Q91X60 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Chrna2Q91X60 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Chrna2Q91X60 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Chrna2Q91X60 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Chrna2Q91X60 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Chrna2Q91X60 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Chrna2Q91X60 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Chrna2Q91X60 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Chrna2Q91X60 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Chrna2Q91X60 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Chrna2Q91X60 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Chrna2Q91X60 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Chrna2Q91X60 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Chrna2Q91X60 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Chrna2Q91X60 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Chrna2Q91X60 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Chrna2Q91X60 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Chrna2Q91X60 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Chrna2Q91X60 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Chrna2Q91X60 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Chrna2Q91X60 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Chrna2Q91X60 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Chrna2Q91X60 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Chrna2Q91X60 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Chrna2Q91X60 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Chrna2Q91X60 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Chrna2Q91X60 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Chrna2Q91X60 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Chrna2Q91X60 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Chrna2Q91X60 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Chrna2Q91X60 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Chrna2Q91X60 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Chrna2Q91X60 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Chrna2Q91X60 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Chrna2Q91X60 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Chrna2Q91X60 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Chrna2Q91X60 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Chrna2Q91X60 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Chrna2Q91X60 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Chrna2Q91X60 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Chrna2Q91X60 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Chrna2Q91X60 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Chrna2Q91X60 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Chrna2Q91X60 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Chrna2Q91X60 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Chrna2Q91X60 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Chrna2Q91X60 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms