Protein–RNA interactions for Protein: Q91W36

Usp3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp3Q91W36 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp3Q91W36 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp3Q91W36 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp3Q91W36 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp3Q91W36 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp3Q91W36 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp3Q91W36 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp3Q91W36 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp3Q91W36 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp3Q91W36 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp3Q91W36 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp3Q91W36 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp3Q91W36 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp3Q91W36 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp3Q91W36 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp3Q91W36 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp3Q91W36 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp3Q91W36 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp3Q91W36 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp3Q91W36 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp3Q91W36 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp3Q91W36 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp3Q91W36 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp3Q91W36 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp3Q91W36 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp3Q91W36 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp3Q91W36 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp3Q91W36 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp3Q91W36 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp3Q91W36 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp3Q91W36 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp3Q91W36 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp3Q91W36 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp3Q91W36 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp3Q91W36 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp3Q91W36 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp3Q91W36 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp3Q91W36 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp3Q91W36 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp3Q91W36 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp3Q91W36 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp3Q91W36 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp3Q91W36 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp3Q91W36 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Usp3Q91W36 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp3Q91W36 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp3Q91W36 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp3Q91W36 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp3Q91W36 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp3Q91W36 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp3Q91W36 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp3Q91W36 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp3Q91W36 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp3Q91W36 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp3Q91W36 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp3Q91W36 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp3Q91W36 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp3Q91W36 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp3Q91W36 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp3Q91W36 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp3Q91W36 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp3Q91W36 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp3Q91W36 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp3Q91W36 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp3Q91W36 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp3Q91W36 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp3Q91W36 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp3Q91W36 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp3Q91W36 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp3Q91W36 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp3Q91W36 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp3Q91W36 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp3Q91W36 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp3Q91W36 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp3Q91W36 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp3Q91W36 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp3Q91W36 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp3Q91W36 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp3Q91W36 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Usp3Q91W36 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Usp3Q91W36 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Usp3Q91W36 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Usp3Q91W36 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp3Q91W36 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp3Q91W36 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp3Q91W36 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp3Q91W36 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp3Q91W36 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp3Q91W36 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp3Q91W36 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp3Q91W36 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp3Q91W36 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp3Q91W36 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp3Q91W36 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp3Q91W36 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp3Q91W36 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp3Q91W36 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp3Q91W36 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp3Q91W36 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp3Q91W36 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms