Protein–RNA interactions for Protein: Q91VN6

Ddx41, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX41, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx41Q91VN6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ddx41Q91VN6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ddx41Q91VN6 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ddx41Q91VN6 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ddx41Q91VN6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ddx41Q91VN6 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ddx41Q91VN6 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ddx41Q91VN6 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ddx41Q91VN6 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ddx41Q91VN6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ddx41Q91VN6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ddx41Q91VN6 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ddx41Q91VN6 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ddx41Q91VN6 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ddx41Q91VN6 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ddx41Q91VN6 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ddx41Q91VN6 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ddx41Q91VN6 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ddx41Q91VN6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ddx41Q91VN6 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ddx41Q91VN6 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ddx41Q91VN6 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ddx41Q91VN6 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ddx41Q91VN6 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ddx41Q91VN6 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ddx41Q91VN6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ddx41Q91VN6 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ddx41Q91VN6 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ddx41Q91VN6 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ddx41Q91VN6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ddx41Q91VN6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ddx41Q91VN6 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ddx41Q91VN6 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ddx41Q91VN6 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Ddx41Q91VN6 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ddx41Q91VN6 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Ddx41Q91VN6 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Ddx41Q91VN6 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ddx41Q91VN6 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Ddx41Q91VN6 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ddx41Q91VN6 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ddx41Q91VN6 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ddx41Q91VN6 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ddx41Q91VN6 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ddx41Q91VN6 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ddx41Q91VN6 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ddx41Q91VN6 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ddx41Q91VN6 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ddx41Q91VN6 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ddx41Q91VN6 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ddx41Q91VN6 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ddx41Q91VN6 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ddx41Q91VN6 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Ddx41Q91VN6 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ddx41Q91VN6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ddx41Q91VN6 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ddx41Q91VN6 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ddx41Q91VN6 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ddx41Q91VN6 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Ddx41Q91VN6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ddx41Q91VN6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ddx41Q91VN6 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ddx41Q91VN6 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ddx41Q91VN6 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ddx41Q91VN6 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ddx41Q91VN6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ddx41Q91VN6 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ddx41Q91VN6 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ddx41Q91VN6 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ddx41Q91VN6 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Ddx41Q91VN6 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ddx41Q91VN6 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ddx41Q91VN6 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ddx41Q91VN6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ddx41Q91VN6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ddx41Q91VN6 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ddx41Q91VN6 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ddx41Q91VN6 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ddx41Q91VN6 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Ddx41Q91VN6 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ddx41Q91VN6 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ddx41Q91VN6 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ddx41Q91VN6 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ddx41Q91VN6 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ddx41Q91VN6 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ddx41Q91VN6 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ddx41Q91VN6 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ddx41Q91VN6 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ddx41Q91VN6 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Ddx41Q91VN6 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ddx41Q91VN6 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ddx41Q91VN6 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ddx41Q91VN6 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ddx41Q91VN6 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ddx41Q91VN6 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ddx41Q91VN6 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ddx41Q91VN6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ddx41Q91VN6 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ddx41Q91VN6 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ddx41Q91VN6 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms