Protein–RNA interactions for Protein: Q91UZ8

Pcdhb11, MCG141285, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdhb11Q91UZ8 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pcdhb11Q91UZ8 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pcdhb11Q91UZ8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pcdhb11Q91UZ8 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pcdhb11Q91UZ8 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcdhb11Q91UZ8 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcdhb11Q91UZ8 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcdhb11Q91UZ8 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcdhb11Q91UZ8 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcdhb11Q91UZ8 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcdhb11Q91UZ8 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcdhb11Q91UZ8 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcdhb11Q91UZ8 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcdhb11Q91UZ8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcdhb11Q91UZ8 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pcdhb11Q91UZ8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pcdhb11Q91UZ8 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pcdhb11Q91UZ8 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pcdhb11Q91UZ8 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pcdhb11Q91UZ8 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pcdhb11Q91UZ8 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pcdhb11Q91UZ8 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pcdhb11Q91UZ8 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pcdhb11Q91UZ8 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pcdhb11Q91UZ8 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pcdhb11Q91UZ8 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pcdhb11Q91UZ8 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pcdhb11Q91UZ8 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pcdhb11Q91UZ8 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pcdhb11Q91UZ8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pcdhb11Q91UZ8 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pcdhb11Q91UZ8 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pcdhb11Q91UZ8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pcdhb11Q91UZ8 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pcdhb11Q91UZ8 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pcdhb11Q91UZ8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pcdhb11Q91UZ8 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pcdhb11Q91UZ8 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcdhb11Q91UZ8 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcdhb11Q91UZ8 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcdhb11Q91UZ8 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcdhb11Q91UZ8 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcdhb11Q91UZ8 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcdhb11Q91UZ8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcdhb11Q91UZ8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcdhb11Q91UZ8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcdhb11Q91UZ8 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcdhb11Q91UZ8 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pcdhb11Q91UZ8 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pcdhb11Q91UZ8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pcdhb11Q91UZ8 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pcdhb11Q91UZ8 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pcdhb11Q91UZ8 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pcdhb11Q91UZ8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pcdhb11Q91UZ8 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pcdhb11Q91UZ8 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Pcdhb11Q91UZ8 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcdhb11Q91UZ8 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcdhb11Q91UZ8 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcdhb11Q91UZ8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcdhb11Q91UZ8 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcdhb11Q91UZ8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcdhb11Q91UZ8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcdhb11Q91UZ8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcdhb11Q91UZ8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcdhb11Q91UZ8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcdhb11Q91UZ8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcdhb11Q91UZ8 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcdhb11Q91UZ8 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcdhb11Q91UZ8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcdhb11Q91UZ8 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcdhb11Q91UZ8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcdhb11Q91UZ8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcdhb11Q91UZ8 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pcdhb11Q91UZ8 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pcdhb11Q91UZ8 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pcdhb11Q91UZ8 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Pcdhb11Q91UZ8 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pcdhb11Q91UZ8 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pcdhb11Q91UZ8 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pcdhb11Q91UZ8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pcdhb11Q91UZ8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pcdhb11Q91UZ8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pcdhb11Q91UZ8 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pcdhb11Q91UZ8 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pcdhb11Q91UZ8 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pcdhb11Q91UZ8 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pcdhb11Q91UZ8 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pcdhb11Q91UZ8 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pcdhb11Q91UZ8 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pcdhb11Q91UZ8 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pcdhb11Q91UZ8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pcdhb11Q91UZ8 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pcdhb11Q91UZ8 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pcdhb11Q91UZ8 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pcdhb11Q91UZ8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pcdhb11Q91UZ8 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pcdhb11Q91UZ8 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pcdhb11Q91UZ8 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pcdhb11Q91UZ8 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms