Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE96

Slc35f6, Solute carrier family 35 member F6, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc35f6Q8VE96 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc35f6Q8VE96 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc35f6Q8VE96 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc35f6Q8VE96 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc35f6Q8VE96 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc35f6Q8VE96 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc35f6Q8VE96 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc35f6Q8VE96 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc35f6Q8VE96 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc35f6Q8VE96 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc35f6Q8VE96 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc35f6Q8VE96 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc35f6Q8VE96 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc35f6Q8VE96 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc35f6Q8VE96 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc35f6Q8VE96 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc35f6Q8VE96 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc35f6Q8VE96 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc35f6Q8VE96 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc35f6Q8VE96 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc35f6Q8VE96 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc35f6Q8VE96 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc35f6Q8VE96 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc35f6Q8VE96 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc35f6Q8VE96 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc35f6Q8VE96 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc35f6Q8VE96 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc35f6Q8VE96 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc35f6Q8VE96 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc35f6Q8VE96 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc35f6Q8VE96 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc35f6Q8VE96 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc35f6Q8VE96 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc35f6Q8VE96 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc35f6Q8VE96 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc35f6Q8VE96 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc35f6Q8VE96 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc35f6Q8VE96 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc35f6Q8VE96 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc35f6Q8VE96 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc35f6Q8VE96 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc35f6Q8VE96 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Slc35f6Q8VE96 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc35f6Q8VE96 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc35f6Q8VE96 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc35f6Q8VE96 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc35f6Q8VE96 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc35f6Q8VE96 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc35f6Q8VE96 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc35f6Q8VE96 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc35f6Q8VE96 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc35f6Q8VE96 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc35f6Q8VE96 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc35f6Q8VE96 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc35f6Q8VE96 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc35f6Q8VE96 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc35f6Q8VE96 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc35f6Q8VE96 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc35f6Q8VE96 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc35f6Q8VE96 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc35f6Q8VE96 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc35f6Q8VE96 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc35f6Q8VE96 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc35f6Q8VE96 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc35f6Q8VE96 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc35f6Q8VE96 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc35f6Q8VE96 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc35f6Q8VE96 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc35f6Q8VE96 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc35f6Q8VE96 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc35f6Q8VE96 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc35f6Q8VE96 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc35f6Q8VE96 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc35f6Q8VE96 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc35f6Q8VE96 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc35f6Q8VE96 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Slc35f6Q8VE96 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Slc35f6Q8VE96 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc35f6Q8VE96 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc35f6Q8VE96 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc35f6Q8VE96 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc35f6Q8VE96 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc35f6Q8VE96 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc35f6Q8VE96 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc35f6Q8VE96 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc35f6Q8VE96 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc35f6Q8VE96 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc35f6Q8VE96 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc35f6Q8VE96 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc35f6Q8VE96 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc35f6Q8VE96 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc35f6Q8VE96 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc35f6Q8VE96 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc35f6Q8VE96 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc35f6Q8VE96 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc35f6Q8VE96 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc35f6Q8VE96 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc35f6Q8VE96 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc35f6Q8VE96 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc35f6Q8VE96 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms