Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC34

Rpap2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase Rpap2, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpap2Q8VC34 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rpap2Q8VC34 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rpap2Q8VC34 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rpap2Q8VC34 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rpap2Q8VC34 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rpap2Q8VC34 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rpap2Q8VC34 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rpap2Q8VC34 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rpap2Q8VC34 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rpap2Q8VC34 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rpap2Q8VC34 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rpap2Q8VC34 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rpap2Q8VC34 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rpap2Q8VC34 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rpap2Q8VC34 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rpap2Q8VC34 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rpap2Q8VC34 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Rpap2Q8VC34 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rpap2Q8VC34 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rpap2Q8VC34 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rpap2Q8VC34 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Rpap2Q8VC34 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rpap2Q8VC34 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Rpap2Q8VC34 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rpap2Q8VC34 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rpap2Q8VC34 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rpap2Q8VC34 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rpap2Q8VC34 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rpap2Q8VC34 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rpap2Q8VC34 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rpap2Q8VC34 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rpap2Q8VC34 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rpap2Q8VC34 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rpap2Q8VC34 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rpap2Q8VC34 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rpap2Q8VC34 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rpap2Q8VC34 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rpap2Q8VC34 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rpap2Q8VC34 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rpap2Q8VC34 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rpap2Q8VC34 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rpap2Q8VC34 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rpap2Q8VC34 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rpap2Q8VC34 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rpap2Q8VC34 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rpap2Q8VC34 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rpap2Q8VC34 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rpap2Q8VC34 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rpap2Q8VC34 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Rpap2Q8VC34 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Rpap2Q8VC34 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rpap2Q8VC34 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rpap2Q8VC34 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rpap2Q8VC34 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Rpap2Q8VC34 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rpap2Q8VC34 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rpap2Q8VC34 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rpap2Q8VC34 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rpap2Q8VC34 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rpap2Q8VC34 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rpap2Q8VC34 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rpap2Q8VC34 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rpap2Q8VC34 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rpap2Q8VC34 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rpap2Q8VC34 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rpap2Q8VC34 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rpap2Q8VC34 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rpap2Q8VC34 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rpap2Q8VC34 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rpap2Q8VC34 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rpap2Q8VC34 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rpap2Q8VC34 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rpap2Q8VC34 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rpap2Q8VC34 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rpap2Q8VC34 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rpap2Q8VC34 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rpap2Q8VC34 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rpap2Q8VC34 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rpap2Q8VC34 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rpap2Q8VC34 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rpap2Q8VC34 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rpap2Q8VC34 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rpap2Q8VC34 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rpap2Q8VC34 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Rpap2Q8VC34 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rpap2Q8VC34 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rpap2Q8VC34 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rpap2Q8VC34 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rpap2Q8VC34 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rpap2Q8VC34 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rpap2Q8VC34 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rpap2Q8VC34 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Rpap2Q8VC34 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rpap2Q8VC34 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rpap2Q8VC34 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rpap2Q8VC34 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rpap2Q8VC34 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rpap2Q8VC34 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rpap2Q8VC34 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rpap2Q8VC34 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms