Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT6

Apobr, Apolipoprotein B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobrQ8VBT6 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ApobrQ8VBT6 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ApobrQ8VBT6 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ApobrQ8VBT6 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ApobrQ8VBT6 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ApobrQ8VBT6 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ApobrQ8VBT6 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ApobrQ8VBT6 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ApobrQ8VBT6 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ApobrQ8VBT6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ApobrQ8VBT6 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ApobrQ8VBT6 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ApobrQ8VBT6 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ApobrQ8VBT6 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ApobrQ8VBT6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ApobrQ8VBT6 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ApobrQ8VBT6 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ApobrQ8VBT6 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ApobrQ8VBT6 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ApobrQ8VBT6 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ApobrQ8VBT6 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ApobrQ8VBT6 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ApobrQ8VBT6 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ApobrQ8VBT6 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ApobrQ8VBT6 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ApobrQ8VBT6 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ApobrQ8VBT6 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ApobrQ8VBT6 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ApobrQ8VBT6 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ApobrQ8VBT6 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ApobrQ8VBT6 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ApobrQ8VBT6 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ApobrQ8VBT6 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ApobrQ8VBT6 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ApobrQ8VBT6 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ApobrQ8VBT6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ApobrQ8VBT6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ApobrQ8VBT6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ApobrQ8VBT6 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.12
ApobrQ8VBT6 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ApobrQ8VBT6 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
ApobrQ8VBT6 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ApobrQ8VBT6 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ApobrQ8VBT6 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ApobrQ8VBT6 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ApobrQ8VBT6 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ApobrQ8VBT6 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ApobrQ8VBT6 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ApobrQ8VBT6 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ApobrQ8VBT6 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
ApobrQ8VBT6 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ApobrQ8VBT6 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ApobrQ8VBT6 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
ApobrQ8VBT6 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
ApobrQ8VBT6 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ApobrQ8VBT6 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ApobrQ8VBT6 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ApobrQ8VBT6 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ApobrQ8VBT6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ApobrQ8VBT6 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ApobrQ8VBT6 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ApobrQ8VBT6 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ApobrQ8VBT6 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
ApobrQ8VBT6 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ApobrQ8VBT6 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ApobrQ8VBT6 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ApobrQ8VBT6 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
ApobrQ8VBT6 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ApobrQ8VBT6 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ApobrQ8VBT6 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ApobrQ8VBT6 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ApobrQ8VBT6 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ApobrQ8VBT6 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ApobrQ8VBT6 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
ApobrQ8VBT6 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ApobrQ8VBT6 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ApobrQ8VBT6 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ApobrQ8VBT6 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ApobrQ8VBT6 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ApobrQ8VBT6 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ApobrQ8VBT6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ApobrQ8VBT6 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ApobrQ8VBT6 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ApobrQ8VBT6 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
ApobrQ8VBT6 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
ApobrQ8VBT6 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ApobrQ8VBT6 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ApobrQ8VBT6 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
ApobrQ8VBT6 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ApobrQ8VBT6 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
ApobrQ8VBT6 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ApobrQ8VBT6 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ApobrQ8VBT6 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ApobrQ8VBT6 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ApobrQ8VBT6 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ApobrQ8VBT6 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ApobrQ8VBT6 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ApobrQ8VBT6 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ApobrQ8VBT6 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ApobrQ8VBT6 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms