Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3P9

Slf1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slf1Q8R3P9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slf1Q8R3P9 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slf1Q8R3P9 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slf1Q8R3P9 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slf1Q8R3P9 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slf1Q8R3P9 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slf1Q8R3P9 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slf1Q8R3P9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slf1Q8R3P9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slf1Q8R3P9 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slf1Q8R3P9 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slf1Q8R3P9 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slf1Q8R3P9 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slf1Q8R3P9 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Slf1Q8R3P9 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slf1Q8R3P9 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slf1Q8R3P9 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slf1Q8R3P9 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slf1Q8R3P9 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slf1Q8R3P9 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slf1Q8R3P9 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slf1Q8R3P9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slf1Q8R3P9 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slf1Q8R3P9 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slf1Q8R3P9 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slf1Q8R3P9 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slf1Q8R3P9 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slf1Q8R3P9 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slf1Q8R3P9 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slf1Q8R3P9 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slf1Q8R3P9 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slf1Q8R3P9 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Slf1Q8R3P9 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
Slf1Q8R3P9 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
Slf1Q8R3P9 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slf1Q8R3P9 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slf1Q8R3P9 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slf1Q8R3P9 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slf1Q8R3P9 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slf1Q8R3P9 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slf1Q8R3P9 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slf1Q8R3P9 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slf1Q8R3P9 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Slf1Q8R3P9 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slf1Q8R3P9 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slf1Q8R3P9 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slf1Q8R3P9 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slf1Q8R3P9 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slf1Q8R3P9 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slf1Q8R3P9 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slf1Q8R3P9 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slf1Q8R3P9 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Slf1Q8R3P9 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slf1Q8R3P9 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slf1Q8R3P9 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slf1Q8R3P9 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slf1Q8R3P9 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slf1Q8R3P9 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slf1Q8R3P9 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slf1Q8R3P9 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slf1Q8R3P9 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slf1Q8R3P9 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slf1Q8R3P9 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slf1Q8R3P9 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slf1Q8R3P9 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slf1Q8R3P9 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slf1Q8R3P9 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slf1Q8R3P9 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slf1Q8R3P9 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slf1Q8R3P9 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slf1Q8R3P9 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slf1Q8R3P9 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slf1Q8R3P9 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slf1Q8R3P9 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slf1Q8R3P9 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Slf1Q8R3P9 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Slf1Q8R3P9 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Slf1Q8R3P9 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Slf1Q8R3P9 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slf1Q8R3P9 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Slf1Q8R3P9 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slf1Q8R3P9 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slf1Q8R3P9 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Slf1Q8R3P9 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slf1Q8R3P9 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slf1Q8R3P9 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slf1Q8R3P9 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slf1Q8R3P9 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slf1Q8R3P9 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slf1Q8R3P9 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slf1Q8R3P9 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slf1Q8R3P9 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slf1Q8R3P9 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slf1Q8R3P9 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slf1Q8R3P9 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slf1Q8R3P9 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slf1Q8R3P9 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slf1Q8R3P9 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slf1Q8R3P9 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slf1Q8R3P9 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
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