Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZQ2

Afg3l2, AFG3-like protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l2Q8JZQ2 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Afg3l2Q8JZQ2 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Afg3l2Q8JZQ2 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Afg3l2Q8JZQ2 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Afg3l2Q8JZQ2 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Afg3l2Q8JZQ2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Afg3l2Q8JZQ2 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Afg3l2Q8JZQ2 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Afg3l2Q8JZQ2 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Afg3l2Q8JZQ2 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Afg3l2Q8JZQ2 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Afg3l2Q8JZQ2 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Afg3l2Q8JZQ2 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Afg3l2Q8JZQ2 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Afg3l2Q8JZQ2 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Afg3l2Q8JZQ2 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Afg3l2Q8JZQ2 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Afg3l2Q8JZQ2 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Afg3l2Q8JZQ2 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Afg3l2Q8JZQ2 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Afg3l2Q8JZQ2 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Afg3l2Q8JZQ2 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Afg3l2Q8JZQ2 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Afg3l2Q8JZQ2 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Afg3l2Q8JZQ2 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Afg3l2Q8JZQ2 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
Afg3l2Q8JZQ2 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Afg3l2Q8JZQ2 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Afg3l2Q8JZQ2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Afg3l2Q8JZQ2 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Afg3l2Q8JZQ2 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Afg3l2Q8JZQ2 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Afg3l2Q8JZQ2 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Afg3l2Q8JZQ2 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Afg3l2Q8JZQ2 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Afg3l2Q8JZQ2 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Afg3l2Q8JZQ2 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Afg3l2Q8JZQ2 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Afg3l2Q8JZQ2 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Afg3l2Q8JZQ2 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Afg3l2Q8JZQ2 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Afg3l2Q8JZQ2 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Afg3l2Q8JZQ2 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Afg3l2Q8JZQ2 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Afg3l2Q8JZQ2 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Afg3l2Q8JZQ2 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Afg3l2Q8JZQ2 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Afg3l2Q8JZQ2 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Afg3l2Q8JZQ2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Afg3l2Q8JZQ2 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Afg3l2Q8JZQ2 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Afg3l2Q8JZQ2 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Afg3l2Q8JZQ2 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Afg3l2Q8JZQ2 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Afg3l2Q8JZQ2 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Afg3l2Q8JZQ2 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Afg3l2Q8JZQ2 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Afg3l2Q8JZQ2 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Afg3l2Q8JZQ2 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Afg3l2Q8JZQ2 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Afg3l2Q8JZQ2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Afg3l2Q8JZQ2 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Afg3l2Q8JZQ2 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Afg3l2Q8JZQ2 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Afg3l2Q8JZQ2 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Afg3l2Q8JZQ2 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Afg3l2Q8JZQ2 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Afg3l2Q8JZQ2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Afg3l2Q8JZQ2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Afg3l2Q8JZQ2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Afg3l2Q8JZQ2 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Afg3l2Q8JZQ2 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Afg3l2Q8JZQ2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Afg3l2Q8JZQ2 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Afg3l2Q8JZQ2 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Afg3l2Q8JZQ2 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Afg3l2Q8JZQ2 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Afg3l2Q8JZQ2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Afg3l2Q8JZQ2 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Afg3l2Q8JZQ2 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Afg3l2Q8JZQ2 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Afg3l2Q8JZQ2 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Afg3l2Q8JZQ2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Afg3l2Q8JZQ2 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Afg3l2Q8JZQ2 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Afg3l2Q8JZQ2 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
Afg3l2Q8JZQ2 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Afg3l2Q8JZQ2 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Afg3l2Q8JZQ2 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Afg3l2Q8JZQ2 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Afg3l2Q8JZQ2 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Afg3l2Q8JZQ2 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Afg3l2Q8JZQ2 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Afg3l2Q8JZQ2 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Afg3l2Q8JZQ2 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Afg3l2Q8JZQ2 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Afg3l2Q8JZQ2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Afg3l2Q8JZQ2 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Afg3l2Q8JZQ2 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Afg3l2Q8JZQ2 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms