Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGZ0

Cherp, Calcium homeostasis endoplasmic reticulum protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 936 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CherpQ8CGZ0 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CherpQ8CGZ0 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CherpQ8CGZ0 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CherpQ8CGZ0 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CherpQ8CGZ0 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CherpQ8CGZ0 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CherpQ8CGZ0 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CherpQ8CGZ0 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CherpQ8CGZ0 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CherpQ8CGZ0 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CherpQ8CGZ0 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CherpQ8CGZ0 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CherpQ8CGZ0 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CherpQ8CGZ0 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CherpQ8CGZ0 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CherpQ8CGZ0 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CherpQ8CGZ0 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CherpQ8CGZ0 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CherpQ8CGZ0 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CherpQ8CGZ0 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CherpQ8CGZ0 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CherpQ8CGZ0 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CherpQ8CGZ0 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CherpQ8CGZ0 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CherpQ8CGZ0 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CherpQ8CGZ0 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CherpQ8CGZ0 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CherpQ8CGZ0 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CherpQ8CGZ0 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CherpQ8CGZ0 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CherpQ8CGZ0 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CherpQ8CGZ0 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CherpQ8CGZ0 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CherpQ8CGZ0 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CherpQ8CGZ0 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CherpQ8CGZ0 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CherpQ8CGZ0 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CherpQ8CGZ0 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CherpQ8CGZ0 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CherpQ8CGZ0 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CherpQ8CGZ0 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CherpQ8CGZ0 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CherpQ8CGZ0 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CherpQ8CGZ0 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CherpQ8CGZ0 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CherpQ8CGZ0 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CherpQ8CGZ0 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CherpQ8CGZ0 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CherpQ8CGZ0 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CherpQ8CGZ0 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CherpQ8CGZ0 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CherpQ8CGZ0 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CherpQ8CGZ0 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CherpQ8CGZ0 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CherpQ8CGZ0 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CherpQ8CGZ0 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CherpQ8CGZ0 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CherpQ8CGZ0 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CherpQ8CGZ0 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CherpQ8CGZ0 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CherpQ8CGZ0 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CherpQ8CGZ0 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CherpQ8CGZ0 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CherpQ8CGZ0 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CherpQ8CGZ0 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CherpQ8CGZ0 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CherpQ8CGZ0 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CherpQ8CGZ0 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CherpQ8CGZ0 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CherpQ8CGZ0 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CherpQ8CGZ0 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CherpQ8CGZ0 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CherpQ8CGZ0 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CherpQ8CGZ0 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CherpQ8CGZ0 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CherpQ8CGZ0 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CherpQ8CGZ0 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CherpQ8CGZ0 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CherpQ8CGZ0 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CherpQ8CGZ0 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CherpQ8CGZ0 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CherpQ8CGZ0 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CherpQ8CGZ0 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CherpQ8CGZ0 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CherpQ8CGZ0 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CherpQ8CGZ0 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CherpQ8CGZ0 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CherpQ8CGZ0 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CherpQ8CGZ0 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CherpQ8CGZ0 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CherpQ8CGZ0 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CherpQ8CGZ0 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CherpQ8CGZ0 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CherpQ8CGZ0 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CherpQ8CGZ0 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CherpQ8CGZ0 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CherpQ8CGZ0 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CherpQ8CGZ0 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CherpQ8CGZ0 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CherpQ8CGZ0 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms