Protein–RNA interactions for Protein: Q8CG27

Actl9, Actin-like protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actl9Q8CG27 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Actl9Q8CG27 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Actl9Q8CG27 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Actl9Q8CG27 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Actl9Q8CG27 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Actl9Q8CG27 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Actl9Q8CG27 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Actl9Q8CG27 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Actl9Q8CG27 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Actl9Q8CG27 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Actl9Q8CG27 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Actl9Q8CG27 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Actl9Q8CG27 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Actl9Q8CG27 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Actl9Q8CG27 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Actl9Q8CG27 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Actl9Q8CG27 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Actl9Q8CG27 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Actl9Q8CG27 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Actl9Q8CG27 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Actl9Q8CG27 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Actl9Q8CG27 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Actl9Q8CG27 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Actl9Q8CG27 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Actl9Q8CG27 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Actl9Q8CG27 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Actl9Q8CG27 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Actl9Q8CG27 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Actl9Q8CG27 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Actl9Q8CG27 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Actl9Q8CG27 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Actl9Q8CG27 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Actl9Q8CG27 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Actl9Q8CG27 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Actl9Q8CG27 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Actl9Q8CG27 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Actl9Q8CG27 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Actl9Q8CG27 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Actl9Q8CG27 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Actl9Q8CG27 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Actl9Q8CG27 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Actl9Q8CG27 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Actl9Q8CG27 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Actl9Q8CG27 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Actl9Q8CG27 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Actl9Q8CG27 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Actl9Q8CG27 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Actl9Q8CG27 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Actl9Q8CG27 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Actl9Q8CG27 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Actl9Q8CG27 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Actl9Q8CG27 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Actl9Q8CG27 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Actl9Q8CG27 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Actl9Q8CG27 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Actl9Q8CG27 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Actl9Q8CG27 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Actl9Q8CG27 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Actl9Q8CG27 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Actl9Q8CG27 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Actl9Q8CG27 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Actl9Q8CG27 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Actl9Q8CG27 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Actl9Q8CG27 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Actl9Q8CG27 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Actl9Q8CG27 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Actl9Q8CG27 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Actl9Q8CG27 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Actl9Q8CG27 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Actl9Q8CG27 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Actl9Q8CG27 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Actl9Q8CG27 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Actl9Q8CG27 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Actl9Q8CG27 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Actl9Q8CG27 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Actl9Q8CG27 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Actl9Q8CG27 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Actl9Q8CG27 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Actl9Q8CG27 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Actl9Q8CG27 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Actl9Q8CG27 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Actl9Q8CG27 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Actl9Q8CG27 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Actl9Q8CG27 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Actl9Q8CG27 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Actl9Q8CG27 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Actl9Q8CG27 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Actl9Q8CG27 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Actl9Q8CG27 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Actl9Q8CG27 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Actl9Q8CG27 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Actl9Q8CG27 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Actl9Q8CG27 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Actl9Q8CG27 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Actl9Q8CG27 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Actl9Q8CG27 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Actl9Q8CG27 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Actl9Q8CG27 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Actl9Q8CG27 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Actl9Q8CG27 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms