Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp27Q8CEG8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp27Q8CEG8 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp27Q8CEG8 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp27Q8CEG8 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp27Q8CEG8 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp27Q8CEG8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp27Q8CEG8 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp27Q8CEG8 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp27Q8CEG8 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp27Q8CEG8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp27Q8CEG8 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp27Q8CEG8 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp27Q8CEG8 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp27Q8CEG8 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp27Q8CEG8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp27Q8CEG8 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp27Q8CEG8 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp27Q8CEG8 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp27Q8CEG8 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp27Q8CEG8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp27Q8CEG8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp27Q8CEG8 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp27Q8CEG8 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Usp27Q8CEG8 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Usp27Q8CEG8 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Usp27Q8CEG8 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp27Q8CEG8 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp27Q8CEG8 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp27Q8CEG8 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp27Q8CEG8 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp27Q8CEG8 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp27Q8CEG8 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp27Q8CEG8 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp27Q8CEG8 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp27Q8CEG8 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp27Q8CEG8 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp27Q8CEG8 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp27Q8CEG8 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp27Q8CEG8 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp27Q8CEG8 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp27Q8CEG8 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp27Q8CEG8 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp27Q8CEG8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp27Q8CEG8 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp27Q8CEG8 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp27Q8CEG8 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp27Q8CEG8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp27Q8CEG8 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp27Q8CEG8 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp27Q8CEG8 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp27Q8CEG8 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp27Q8CEG8 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp27Q8CEG8 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp27Q8CEG8 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp27Q8CEG8 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp27Q8CEG8 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp27Q8CEG8 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp27Q8CEG8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp27Q8CEG8 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp27Q8CEG8 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp27Q8CEG8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Usp27Q8CEG8 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Usp27Q8CEG8 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Usp27Q8CEG8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp27Q8CEG8 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp27Q8CEG8 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp27Q8CEG8 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp27Q8CEG8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp27Q8CEG8 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp27Q8CEG8 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp27Q8CEG8 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp27Q8CEG8 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp27Q8CEG8 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp27Q8CEG8 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp27Q8CEG8 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp27Q8CEG8 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp27Q8CEG8 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp27Q8CEG8 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp27Q8CEG8 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp27Q8CEG8 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp27Q8CEG8 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp27Q8CEG8 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp27Q8CEG8 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp27Q8CEG8 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp27Q8CEG8 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp27Q8CEG8 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp27Q8CEG8 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp27Q8CEG8 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp27Q8CEG8 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp27Q8CEG8 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp27Q8CEG8 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp27Q8CEG8 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp27Q8CEG8 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp27Q8CEG8 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp27Q8CEG8 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp27Q8CEG8 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp27Q8CEG8 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp27Q8CEG8 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp27Q8CEG8 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
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