Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD60

UPF0583 protein C15orf59 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8CD60 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Q8CD60 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Q8CD60 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Q8CD60 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q8CD60 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q8CD60 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q8CD60 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q8CD60 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q8CD60 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q8CD60 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q8CD60 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q8CD60 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q8CD60 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q8CD60 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q8CD60 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Q8CD60 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Q8CD60 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Q8CD60 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Q8CD60 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Q8CD60 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Q8CD60 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Q8CD60 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Q8CD60 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Q8CD60 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Q8CD60 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Q8CD60 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Q8CD60 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Q8CD60 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Q8CD60 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Q8CD60 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Q8CD60 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Q8CD60 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Q8CD60 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Q8CD60 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Q8CD60 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Q8CD60 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q8CD60 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q8CD60 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q8CD60 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q8CD60 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Q8CD60 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q8CD60 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q8CD60 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q8CD60 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Q8CD60 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Q8CD60 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Q8CD60 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Q8CD60 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Q8CD60 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Q8CD60 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Q8CD60 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Q8CD60 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Q8CD60 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Q8CD60 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Q8CD60 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Q8CD60 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Q8CD60 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Q8CD60 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Q8CD60 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Q8CD60 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Q8CD60 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Q8CD60 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Q8CD60 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Q8CD60 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Q8CD60 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Q8CD60 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Q8CD60 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Q8CD60 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Q8CD60 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Q8CD60 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Q8CD60 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Q8CD60 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Q8CD60 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Q8CD60 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Q8CD60 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Q8CD60 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Q8CD60 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Q8CD60 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Q8CD60 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Q8CD60 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Q8CD60 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Q8CD60 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Q8CD60 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Q8CD60 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Q8CD60 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Q8CD60 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Q8CD60 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Q8CD60 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Q8CD60 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Q8CD60 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Q8CD60 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Q8CD60 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Q8CD60 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Q8CD60 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Q8CD60 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Q8CD60 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Q8CD60 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Q8CD60 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Q8CD60 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Q8CD60 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms