Protein–RNA interactions for Protein: Q8CB19

Phtf2, Putative homeodomain transcription factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phtf2Q8CB19 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Phtf2Q8CB19 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Phtf2Q8CB19 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Phtf2Q8CB19 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Phtf2Q8CB19 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Phtf2Q8CB19 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Phtf2Q8CB19 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Phtf2Q8CB19 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Phtf2Q8CB19 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Phtf2Q8CB19 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Phtf2Q8CB19 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Phtf2Q8CB19 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Phtf2Q8CB19 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Phtf2Q8CB19 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Phtf2Q8CB19 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Phtf2Q8CB19 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Phtf2Q8CB19 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Phtf2Q8CB19 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Phtf2Q8CB19 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Phtf2Q8CB19 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Phtf2Q8CB19 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Phtf2Q8CB19 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Phtf2Q8CB19 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Phtf2Q8CB19 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Phtf2Q8CB19 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Phtf2Q8CB19 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Phtf2Q8CB19 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Phtf2Q8CB19 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Phtf2Q8CB19 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Phtf2Q8CB19 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Phtf2Q8CB19 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Phtf2Q8CB19 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Phtf2Q8CB19 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Phtf2Q8CB19 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Phtf2Q8CB19 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Phtf2Q8CB19 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Phtf2Q8CB19 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Phtf2Q8CB19 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Phtf2Q8CB19 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Phtf2Q8CB19 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Phtf2Q8CB19 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Phtf2Q8CB19 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Phtf2Q8CB19 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Phtf2Q8CB19 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Phtf2Q8CB19 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Phtf2Q8CB19 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Phtf2Q8CB19 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Phtf2Q8CB19 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Phtf2Q8CB19 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Phtf2Q8CB19 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Phtf2Q8CB19 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Phtf2Q8CB19 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Phtf2Q8CB19 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Phtf2Q8CB19 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Phtf2Q8CB19 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Phtf2Q8CB19 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Phtf2Q8CB19 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Phtf2Q8CB19 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Phtf2Q8CB19 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Phtf2Q8CB19 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Phtf2Q8CB19 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Phtf2Q8CB19 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Phtf2Q8CB19 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Phtf2Q8CB19 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Phtf2Q8CB19 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Phtf2Q8CB19 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Phtf2Q8CB19 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Phtf2Q8CB19 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Phtf2Q8CB19 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Phtf2Q8CB19 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Phtf2Q8CB19 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Phtf2Q8CB19 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Phtf2Q8CB19 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Phtf2Q8CB19 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Phtf2Q8CB19 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Phtf2Q8CB19 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Phtf2Q8CB19 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Phtf2Q8CB19 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Phtf2Q8CB19 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Phtf2Q8CB19 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Phtf2Q8CB19 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Phtf2Q8CB19 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Phtf2Q8CB19 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Phtf2Q8CB19 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Phtf2Q8CB19 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Phtf2Q8CB19 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Phtf2Q8CB19 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Phtf2Q8CB19 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Phtf2Q8CB19 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Phtf2Q8CB19 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Phtf2Q8CB19 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Phtf2Q8CB19 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Phtf2Q8CB19 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Phtf2Q8CB19 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Phtf2Q8CB19 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Phtf2Q8CB19 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Phtf2Q8CB19 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Phtf2Q8CB19 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Phtf2Q8CB19 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Phtf2Q8CB19 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms