Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9J3

Spef2, Sperm flagellar protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spef2Q8C9J3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Spef2Q8C9J3 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Spef2Q8C9J3 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Spef2Q8C9J3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Spef2Q8C9J3 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Spef2Q8C9J3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Spef2Q8C9J3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Spef2Q8C9J3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Spef2Q8C9J3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Spef2Q8C9J3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Spef2Q8C9J3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Spef2Q8C9J3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Spef2Q8C9J3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Spef2Q8C9J3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Spef2Q8C9J3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Spef2Q8C9J3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Spef2Q8C9J3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Spef2Q8C9J3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Spef2Q8C9J3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Spef2Q8C9J3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Spef2Q8C9J3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Spef2Q8C9J3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Spef2Q8C9J3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Spef2Q8C9J3 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Spef2Q8C9J3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Spef2Q8C9J3 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Spef2Q8C9J3 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Spef2Q8C9J3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Spef2Q8C9J3 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Spef2Q8C9J3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Spef2Q8C9J3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Spef2Q8C9J3 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Spef2Q8C9J3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Spef2Q8C9J3 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Spef2Q8C9J3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Spef2Q8C9J3 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Spef2Q8C9J3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Spef2Q8C9J3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Spef2Q8C9J3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Spef2Q8C9J3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Spef2Q8C9J3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Spef2Q8C9J3 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Spef2Q8C9J3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Spef2Q8C9J3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Spef2Q8C9J3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Spef2Q8C9J3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Spef2Q8C9J3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Spef2Q8C9J3 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Spef2Q8C9J3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Spef2Q8C9J3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Spef2Q8C9J3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Spef2Q8C9J3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Spef2Q8C9J3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Spef2Q8C9J3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Spef2Q8C9J3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Spef2Q8C9J3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Spef2Q8C9J3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Spef2Q8C9J3 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Spef2Q8C9J3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Spef2Q8C9J3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Spef2Q8C9J3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Spef2Q8C9J3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Spef2Q8C9J3 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Spef2Q8C9J3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Spef2Q8C9J3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Spef2Q8C9J3 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Spef2Q8C9J3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Spef2Q8C9J3 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Spef2Q8C9J3 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Spef2Q8C9J3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Spef2Q8C9J3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Spef2Q8C9J3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Spef2Q8C9J3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Spef2Q8C9J3 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Spef2Q8C9J3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Spef2Q8C9J3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Spef2Q8C9J3 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Spef2Q8C9J3 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Spef2Q8C9J3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
Spef2Q8C9J3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Spef2Q8C9J3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Spef2Q8C9J3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Spef2Q8C9J3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Spef2Q8C9J3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Spef2Q8C9J3 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Spef2Q8C9J3 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Spef2Q8C9J3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Spef2Q8C9J3 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Spef2Q8C9J3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Spef2Q8C9J3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Spef2Q8C9J3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Spef2Q8C9J3 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Spef2Q8C9J3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Spef2Q8C9J3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Spef2Q8C9J3 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Spef2Q8C9J3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Spef2Q8C9J3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Spef2Q8C9J3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Spef2Q8C9J3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Spef2Q8C9J3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.3 ms