Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8U0

Ppfibp1, Liprin-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp1Q8C8U0 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ppfibp1Q8C8U0 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ppfibp1Q8C8U0 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ppfibp1Q8C8U0 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ppfibp1Q8C8U0 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ppfibp1Q8C8U0 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ppfibp1Q8C8U0 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ppfibp1Q8C8U0 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ppfibp1Q8C8U0 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ppfibp1Q8C8U0 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ppfibp1Q8C8U0 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ppfibp1Q8C8U0 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ppfibp1Q8C8U0 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ppfibp1Q8C8U0 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ppfibp1Q8C8U0 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ppfibp1Q8C8U0 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ppfibp1Q8C8U0 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ppfibp1Q8C8U0 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ppfibp1Q8C8U0 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ppfibp1Q8C8U0 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ppfibp1Q8C8U0 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ppfibp1Q8C8U0 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ppfibp1Q8C8U0 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ppfibp1Q8C8U0 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Ppfibp1Q8C8U0 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ppfibp1Q8C8U0 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ppfibp1Q8C8U0 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ppfibp1Q8C8U0 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ppfibp1Q8C8U0 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ppfibp1Q8C8U0 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ppfibp1Q8C8U0 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ppfibp1Q8C8U0 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ppfibp1Q8C8U0 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ppfibp1Q8C8U0 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ppfibp1Q8C8U0 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ppfibp1Q8C8U0 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ppfibp1Q8C8U0 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ppfibp1Q8C8U0 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ppfibp1Q8C8U0 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ppfibp1Q8C8U0 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ppfibp1Q8C8U0 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ppfibp1Q8C8U0 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ppfibp1Q8C8U0 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ppfibp1Q8C8U0 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ppfibp1Q8C8U0 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ppfibp1Q8C8U0 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ppfibp1Q8C8U0 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ppfibp1Q8C8U0 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ppfibp1Q8C8U0 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ppfibp1Q8C8U0 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ppfibp1Q8C8U0 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ppfibp1Q8C8U0 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ppfibp1Q8C8U0 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ppfibp1Q8C8U0 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ppfibp1Q8C8U0 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ppfibp1Q8C8U0 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ppfibp1Q8C8U0 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ppfibp1Q8C8U0 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ppfibp1Q8C8U0 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ppfibp1Q8C8U0 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ppfibp1Q8C8U0 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ppfibp1Q8C8U0 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ppfibp1Q8C8U0 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ppfibp1Q8C8U0 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ppfibp1Q8C8U0 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ppfibp1Q8C8U0 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ppfibp1Q8C8U0 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ppfibp1Q8C8U0 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Ppfibp1Q8C8U0 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Ppfibp1Q8C8U0 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ppfibp1Q8C8U0 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ppfibp1Q8C8U0 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ppfibp1Q8C8U0 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ppfibp1Q8C8U0 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ppfibp1Q8C8U0 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Ppfibp1Q8C8U0 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ppfibp1Q8C8U0 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ppfibp1Q8C8U0 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ppfibp1Q8C8U0 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ppfibp1Q8C8U0 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ppfibp1Q8C8U0 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ppfibp1Q8C8U0 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ppfibp1Q8C8U0 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ppfibp1Q8C8U0 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Ppfibp1Q8C8U0 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Ppfibp1Q8C8U0 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ppfibp1Q8C8U0 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ppfibp1Q8C8U0 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ppfibp1Q8C8U0 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ppfibp1Q8C8U0 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ppfibp1Q8C8U0 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ppfibp1Q8C8U0 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ppfibp1Q8C8U0 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ppfibp1Q8C8U0 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ppfibp1Q8C8U0 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ppfibp1Q8C8U0 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Ppfibp1Q8C8U0 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ppfibp1Q8C8U0 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ppfibp1Q8C8U0 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ppfibp1Q8C8U0 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms