Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8T8

Tsr2, Pre-rRNA-processing protein TSR2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr2Q8C8T8 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tsr2Q8C8T8 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tsr2Q8C8T8 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tsr2Q8C8T8 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tsr2Q8C8T8 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tsr2Q8C8T8 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tsr2Q8C8T8 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tsr2Q8C8T8 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tsr2Q8C8T8 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tsr2Q8C8T8 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tsr2Q8C8T8 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tsr2Q8C8T8 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tsr2Q8C8T8 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tsr2Q8C8T8 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tsr2Q8C8T8 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tsr2Q8C8T8 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Tsr2Q8C8T8 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tsr2Q8C8T8 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tsr2Q8C8T8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tsr2Q8C8T8 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tsr2Q8C8T8 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tsr2Q8C8T8 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tsr2Q8C8T8 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tsr2Q8C8T8 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tsr2Q8C8T8 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tsr2Q8C8T8 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tsr2Q8C8T8 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tsr2Q8C8T8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tsr2Q8C8T8 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tsr2Q8C8T8 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tsr2Q8C8T8 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tsr2Q8C8T8 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tsr2Q8C8T8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tsr2Q8C8T8 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tsr2Q8C8T8 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tsr2Q8C8T8 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tsr2Q8C8T8 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tsr2Q8C8T8 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tsr2Q8C8T8 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tsr2Q8C8T8 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tsr2Q8C8T8 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tsr2Q8C8T8 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tsr2Q8C8T8 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tsr2Q8C8T8 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tsr2Q8C8T8 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tsr2Q8C8T8 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tsr2Q8C8T8 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tsr2Q8C8T8 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tsr2Q8C8T8 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tsr2Q8C8T8 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Tsr2Q8C8T8 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tsr2Q8C8T8 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Tsr2Q8C8T8 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tsr2Q8C8T8 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tsr2Q8C8T8 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Tsr2Q8C8T8 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tsr2Q8C8T8 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tsr2Q8C8T8 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Tsr2Q8C8T8 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tsr2Q8C8T8 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tsr2Q8C8T8 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tsr2Q8C8T8 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tsr2Q8C8T8 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tsr2Q8C8T8 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tsr2Q8C8T8 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tsr2Q8C8T8 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tsr2Q8C8T8 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tsr2Q8C8T8 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tsr2Q8C8T8 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tsr2Q8C8T8 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tsr2Q8C8T8 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tsr2Q8C8T8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tsr2Q8C8T8 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tsr2Q8C8T8 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tsr2Q8C8T8 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tsr2Q8C8T8 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tsr2Q8C8T8 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tsr2Q8C8T8 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tsr2Q8C8T8 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tsr2Q8C8T8 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tsr2Q8C8T8 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Tsr2Q8C8T8 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tsr2Q8C8T8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tsr2Q8C8T8 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tsr2Q8C8T8 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tsr2Q8C8T8 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tsr2Q8C8T8 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tsr2Q8C8T8 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tsr2Q8C8T8 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tsr2Q8C8T8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tsr2Q8C8T8 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tsr2Q8C8T8 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tsr2Q8C8T8 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tsr2Q8C8T8 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tsr2Q8C8T8 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tsr2Q8C8T8 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Tsr2Q8C8T8 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tsr2Q8C8T8 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tsr2Q8C8T8 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tsr2Q8C8T8 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.2 ms