Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6A8

Bhlhe22, Class E basic helix-loop-helix protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe22Q8C6A8 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Bhlhe22Q8C6A8 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Bhlhe22Q8C6A8 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Bhlhe22Q8C6A8 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Bhlhe22Q8C6A8 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Bhlhe22Q8C6A8 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Bhlhe22Q8C6A8 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Bhlhe22Q8C6A8 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Bhlhe22Q8C6A8 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Bhlhe22Q8C6A8 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Bhlhe22Q8C6A8 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Bhlhe22Q8C6A8 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Bhlhe22Q8C6A8 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Bhlhe22Q8C6A8 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Bhlhe22Q8C6A8 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Bhlhe22Q8C6A8 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Bhlhe22Q8C6A8 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Bhlhe22Q8C6A8 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Bhlhe22Q8C6A8 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Bhlhe22Q8C6A8 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Bhlhe22Q8C6A8 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Bhlhe22Q8C6A8 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Bhlhe22Q8C6A8 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Bhlhe22Q8C6A8 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Bhlhe22Q8C6A8 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Bhlhe22Q8C6A8 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Bhlhe22Q8C6A8 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Bhlhe22Q8C6A8 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Bhlhe22Q8C6A8 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Bhlhe22Q8C6A8 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Bhlhe22Q8C6A8 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Bhlhe22Q8C6A8 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Bhlhe22Q8C6A8 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Bhlhe22Q8C6A8 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Bhlhe22Q8C6A8 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Bhlhe22Q8C6A8 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Bhlhe22Q8C6A8 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Bhlhe22Q8C6A8 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Bhlhe22Q8C6A8 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Bhlhe22Q8C6A8 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Bhlhe22Q8C6A8 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Bhlhe22Q8C6A8 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Bhlhe22Q8C6A8 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Bhlhe22Q8C6A8 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Bhlhe22Q8C6A8 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Bhlhe22Q8C6A8 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Bhlhe22Q8C6A8 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Bhlhe22Q8C6A8 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Bhlhe22Q8C6A8 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Bhlhe22Q8C6A8 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Bhlhe22Q8C6A8 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Bhlhe22Q8C6A8 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Bhlhe22Q8C6A8 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Bhlhe22Q8C6A8 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Bhlhe22Q8C6A8 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Bhlhe22Q8C6A8 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Bhlhe22Q8C6A8 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Bhlhe22Q8C6A8 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Bhlhe22Q8C6A8 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Bhlhe22Q8C6A8 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Bhlhe22Q8C6A8 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Bhlhe22Q8C6A8 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Bhlhe22Q8C6A8 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Bhlhe22Q8C6A8 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Bhlhe22Q8C6A8 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Bhlhe22Q8C6A8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Bhlhe22Q8C6A8 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Bhlhe22Q8C6A8 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Bhlhe22Q8C6A8 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Bhlhe22Q8C6A8 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Bhlhe22Q8C6A8 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Bhlhe22Q8C6A8 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Bhlhe22Q8C6A8 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Bhlhe22Q8C6A8 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Bhlhe22Q8C6A8 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Bhlhe22Q8C6A8 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Bhlhe22Q8C6A8 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Bhlhe22Q8C6A8 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Bhlhe22Q8C6A8 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Bhlhe22Q8C6A8 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Bhlhe22Q8C6A8 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Bhlhe22Q8C6A8 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Bhlhe22Q8C6A8 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Bhlhe22Q8C6A8 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Bhlhe22Q8C6A8 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Bhlhe22Q8C6A8 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Bhlhe22Q8C6A8 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Bhlhe22Q8C6A8 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Bhlhe22Q8C6A8 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Bhlhe22Q8C6A8 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Bhlhe22Q8C6A8 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Bhlhe22Q8C6A8 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Bhlhe22Q8C6A8 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Bhlhe22Q8C6A8 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Bhlhe22Q8C6A8 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Bhlhe22Q8C6A8 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Bhlhe22Q8C6A8 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Bhlhe22Q8C6A8 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Bhlhe22Q8C6A8 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Bhlhe22Q8C6A8 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms