Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5U9

Ubqln3, Ubiquilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubqln3Q8C5U9 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ubqln3Q8C5U9 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ubqln3Q8C5U9 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ubqln3Q8C5U9 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ubqln3Q8C5U9 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ubqln3Q8C5U9 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ubqln3Q8C5U9 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ubqln3Q8C5U9 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ubqln3Q8C5U9 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ubqln3Q8C5U9 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Ubqln3Q8C5U9 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ubqln3Q8C5U9 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ubqln3Q8C5U9 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ubqln3Q8C5U9 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ubqln3Q8C5U9 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ubqln3Q8C5U9 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ubqln3Q8C5U9 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ubqln3Q8C5U9 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ubqln3Q8C5U9 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ubqln3Q8C5U9 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ubqln3Q8C5U9 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ubqln3Q8C5U9 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ubqln3Q8C5U9 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ubqln3Q8C5U9 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ubqln3Q8C5U9 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ubqln3Q8C5U9 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ubqln3Q8C5U9 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ubqln3Q8C5U9 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ubqln3Q8C5U9 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ubqln3Q8C5U9 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Ubqln3Q8C5U9 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ubqln3Q8C5U9 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ubqln3Q8C5U9 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ubqln3Q8C5U9 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ubqln3Q8C5U9 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ubqln3Q8C5U9 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ubqln3Q8C5U9 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ubqln3Q8C5U9 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ubqln3Q8C5U9 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ubqln3Q8C5U9 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ubqln3Q8C5U9 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ubqln3Q8C5U9 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ubqln3Q8C5U9 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ubqln3Q8C5U9 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ubqln3Q8C5U9 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ubqln3Q8C5U9 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ubqln3Q8C5U9 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ubqln3Q8C5U9 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ubqln3Q8C5U9 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ubqln3Q8C5U9 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Ubqln3Q8C5U9 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ubqln3Q8C5U9 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ubqln3Q8C5U9 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ubqln3Q8C5U9 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ubqln3Q8C5U9 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ubqln3Q8C5U9 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ubqln3Q8C5U9 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ubqln3Q8C5U9 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ubqln3Q8C5U9 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ubqln3Q8C5U9 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ubqln3Q8C5U9 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ubqln3Q8C5U9 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ubqln3Q8C5U9 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ubqln3Q8C5U9 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
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Ubqln3Q8C5U9 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ubqln3Q8C5U9 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ubqln3Q8C5U9 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ubqln3Q8C5U9 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ubqln3Q8C5U9 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ubqln3Q8C5U9 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ubqln3Q8C5U9 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ubqln3Q8C5U9 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ubqln3Q8C5U9 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ubqln3Q8C5U9 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ubqln3Q8C5U9 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ubqln3Q8C5U9 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ubqln3Q8C5U9 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ubqln3Q8C5U9 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
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Ubqln3Q8C5U9 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Ubqln3Q8C5U9 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ubqln3Q8C5U9 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Ubqln3Q8C5U9 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Ubqln3Q8C5U9 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Ubqln3Q8C5U9 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ubqln3Q8C5U9 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ubqln3Q8C5U9 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ubqln3Q8C5U9 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ubqln3Q8C5U9 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Ubqln3Q8C5U9 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ubqln3Q8C5U9 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Ubqln3Q8C5U9 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ubqln3Q8C5U9 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ubqln3Q8C5U9 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ubqln3Q8C5U9 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Ubqln3Q8C5U9 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ubqln3Q8C5U9 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ubqln3Q8C5U9 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms