Protein–RNA interactions for Protein: Q8C4J0

Ccdc60, Coiled-coil domain-containing protein 60, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc60Q8C4J0 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ccdc60Q8C4J0 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ccdc60Q8C4J0 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ccdc60Q8C4J0 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ccdc60Q8C4J0 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ccdc60Q8C4J0 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ccdc60Q8C4J0 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ccdc60Q8C4J0 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ccdc60Q8C4J0 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ccdc60Q8C4J0 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ccdc60Q8C4J0 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ccdc60Q8C4J0 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ccdc60Q8C4J0 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ccdc60Q8C4J0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ccdc60Q8C4J0 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ccdc60Q8C4J0 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ccdc60Q8C4J0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ccdc60Q8C4J0 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Ccdc60Q8C4J0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ccdc60Q8C4J0 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ccdc60Q8C4J0 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ccdc60Q8C4J0 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ccdc60Q8C4J0 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ccdc60Q8C4J0 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ccdc60Q8C4J0 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ccdc60Q8C4J0 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ccdc60Q8C4J0 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ccdc60Q8C4J0 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ccdc60Q8C4J0 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ccdc60Q8C4J0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ccdc60Q8C4J0 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ccdc60Q8C4J0 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ccdc60Q8C4J0 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Ccdc60Q8C4J0 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ccdc60Q8C4J0 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ccdc60Q8C4J0 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ccdc60Q8C4J0 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ccdc60Q8C4J0 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ccdc60Q8C4J0 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
Ccdc60Q8C4J0 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ccdc60Q8C4J0 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ccdc60Q8C4J0 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ccdc60Q8C4J0 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ccdc60Q8C4J0 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ccdc60Q8C4J0 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ccdc60Q8C4J0 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ccdc60Q8C4J0 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ccdc60Q8C4J0 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ccdc60Q8C4J0 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ccdc60Q8C4J0 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ccdc60Q8C4J0 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ccdc60Q8C4J0 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ccdc60Q8C4J0 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ccdc60Q8C4J0 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ccdc60Q8C4J0 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ccdc60Q8C4J0 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Ccdc60Q8C4J0 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ccdc60Q8C4J0 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ccdc60Q8C4J0 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ccdc60Q8C4J0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Ccdc60Q8C4J0 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ccdc60Q8C4J0 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ccdc60Q8C4J0 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ccdc60Q8C4J0 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ccdc60Q8C4J0 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ccdc60Q8C4J0 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ccdc60Q8C4J0 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ccdc60Q8C4J0 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ccdc60Q8C4J0 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ccdc60Q8C4J0 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ccdc60Q8C4J0 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ccdc60Q8C4J0 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ccdc60Q8C4J0 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ccdc60Q8C4J0 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ccdc60Q8C4J0 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ccdc60Q8C4J0 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Ccdc60Q8C4J0 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ccdc60Q8C4J0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ccdc60Q8C4J0 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ccdc60Q8C4J0 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ccdc60Q8C4J0 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ccdc60Q8C4J0 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ccdc60Q8C4J0 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ccdc60Q8C4J0 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ccdc60Q8C4J0 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ccdc60Q8C4J0 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ccdc60Q8C4J0 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ccdc60Q8C4J0 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ccdc60Q8C4J0 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ccdc60Q8C4J0 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ccdc60Q8C4J0 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ccdc60Q8C4J0 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ccdc60Q8C4J0 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Ccdc60Q8C4J0 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ccdc60Q8C4J0 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ccdc60Q8C4J0 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ccdc60Q8C4J0 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ccdc60Q8C4J0 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ccdc60Q8C4J0 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Ccdc60Q8C4J0 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms