Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXX9

Ccdc169, Coiled-coil domain-containing protein 169, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc169Q8BXX9 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc169Q8BXX9 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc169Q8BXX9 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc169Q8BXX9 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc169Q8BXX9 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc169Q8BXX9 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc169Q8BXX9 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc169Q8BXX9 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc169Q8BXX9 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc169Q8BXX9 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc169Q8BXX9 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc169Q8BXX9 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc169Q8BXX9 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc169Q8BXX9 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc169Q8BXX9 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc169Q8BXX9 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ccdc169Q8BXX9 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ccdc169Q8BXX9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc169Q8BXX9 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc169Q8BXX9 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc169Q8BXX9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc169Q8BXX9 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc169Q8BXX9 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc169Q8BXX9 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc169Q8BXX9 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc169Q8BXX9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc169Q8BXX9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc169Q8BXX9 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc169Q8BXX9 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc169Q8BXX9 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc169Q8BXX9 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc169Q8BXX9 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc169Q8BXX9 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc169Q8BXX9 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc169Q8BXX9 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc169Q8BXX9 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc169Q8BXX9 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc169Q8BXX9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc169Q8BXX9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc169Q8BXX9 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc169Q8BXX9 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc169Q8BXX9 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc169Q8BXX9 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc169Q8BXX9 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc169Q8BXX9 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc169Q8BXX9 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc169Q8BXX9 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc169Q8BXX9 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc169Q8BXX9 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc169Q8BXX9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc169Q8BXX9 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc169Q8BXX9 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc169Q8BXX9 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc169Q8BXX9 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc169Q8BXX9 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc169Q8BXX9 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc169Q8BXX9 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc169Q8BXX9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc169Q8BXX9 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc169Q8BXX9 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc169Q8BXX9 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc169Q8BXX9 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc169Q8BXX9 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc169Q8BXX9 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc169Q8BXX9 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc169Q8BXX9 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc169Q8BXX9 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc169Q8BXX9 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc169Q8BXX9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc169Q8BXX9 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc169Q8BXX9 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc169Q8BXX9 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc169Q8BXX9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc169Q8BXX9 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc169Q8BXX9 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc169Q8BXX9 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc169Q8BXX9 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc169Q8BXX9 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc169Q8BXX9 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc169Q8BXX9 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc169Q8BXX9 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc169Q8BXX9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc169Q8BXX9 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc169Q8BXX9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc169Q8BXX9 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc169Q8BXX9 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc169Q8BXX9 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc169Q8BXX9 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc169Q8BXX9 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc169Q8BXX9 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc169Q8BXX9 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc169Q8BXX9 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc169Q8BXX9 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc169Q8BXX9 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc169Q8BXX9 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc169Q8BXX9 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc169Q8BXX9 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc169Q8BXX9 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc169Q8BXX9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc169Q8BXX9 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms