Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXJ2

Trerf1, Transcriptional-regulating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trerf1Q8BXJ2 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trerf1Q8BXJ2 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trerf1Q8BXJ2 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trerf1Q8BXJ2 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Trerf1Q8BXJ2 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trerf1Q8BXJ2 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trerf1Q8BXJ2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trerf1Q8BXJ2 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trerf1Q8BXJ2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trerf1Q8BXJ2 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trerf1Q8BXJ2 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trerf1Q8BXJ2 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trerf1Q8BXJ2 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trerf1Q8BXJ2 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trerf1Q8BXJ2 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trerf1Q8BXJ2 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trerf1Q8BXJ2 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trerf1Q8BXJ2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trerf1Q8BXJ2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trerf1Q8BXJ2 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trerf1Q8BXJ2 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trerf1Q8BXJ2 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trerf1Q8BXJ2 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trerf1Q8BXJ2 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trerf1Q8BXJ2 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trerf1Q8BXJ2 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trerf1Q8BXJ2 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trerf1Q8BXJ2 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trerf1Q8BXJ2 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trerf1Q8BXJ2 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trerf1Q8BXJ2 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trerf1Q8BXJ2 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trerf1Q8BXJ2 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trerf1Q8BXJ2 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trerf1Q8BXJ2 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trerf1Q8BXJ2 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trerf1Q8BXJ2 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Trerf1Q8BXJ2 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trerf1Q8BXJ2 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trerf1Q8BXJ2 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trerf1Q8BXJ2 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trerf1Q8BXJ2 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trerf1Q8BXJ2 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trerf1Q8BXJ2 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trerf1Q8BXJ2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trerf1Q8BXJ2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trerf1Q8BXJ2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trerf1Q8BXJ2 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trerf1Q8BXJ2 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trerf1Q8BXJ2 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trerf1Q8BXJ2 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trerf1Q8BXJ2 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trerf1Q8BXJ2 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trerf1Q8BXJ2 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trerf1Q8BXJ2 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trerf1Q8BXJ2 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trerf1Q8BXJ2 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trerf1Q8BXJ2 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trerf1Q8BXJ2 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trerf1Q8BXJ2 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trerf1Q8BXJ2 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trerf1Q8BXJ2 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Trerf1Q8BXJ2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trerf1Q8BXJ2 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trerf1Q8BXJ2 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trerf1Q8BXJ2 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trerf1Q8BXJ2 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Trerf1Q8BXJ2 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trerf1Q8BXJ2 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trerf1Q8BXJ2 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trerf1Q8BXJ2 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trerf1Q8BXJ2 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trerf1Q8BXJ2 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Trerf1Q8BXJ2 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trerf1Q8BXJ2 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trerf1Q8BXJ2 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trerf1Q8BXJ2 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trerf1Q8BXJ2 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trerf1Q8BXJ2 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Trerf1Q8BXJ2 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trerf1Q8BXJ2 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trerf1Q8BXJ2 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trerf1Q8BXJ2 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trerf1Q8BXJ2 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trerf1Q8BXJ2 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trerf1Q8BXJ2 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trerf1Q8BXJ2 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trerf1Q8BXJ2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trerf1Q8BXJ2 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Trerf1Q8BXJ2 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trerf1Q8BXJ2 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trerf1Q8BXJ2 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trerf1Q8BXJ2 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trerf1Q8BXJ2 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Trerf1Q8BXJ2 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trerf1Q8BXJ2 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trerf1Q8BXJ2 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trerf1Q8BXJ2 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trerf1Q8BXJ2 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trerf1Q8BXJ2 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.3 ms