Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW49

Ttc12, Tetratricopeptide repeat protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 704 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc12Q8BW49 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ttc12Q8BW49 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ttc12Q8BW49 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ttc12Q8BW49 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ttc12Q8BW49 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ttc12Q8BW49 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ttc12Q8BW49 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ttc12Q8BW49 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ttc12Q8BW49 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ttc12Q8BW49 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ttc12Q8BW49 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ttc12Q8BW49 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Ttc12Q8BW49 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ttc12Q8BW49 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ttc12Q8BW49 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Ttc12Q8BW49 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ttc12Q8BW49 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ttc12Q8BW49 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ttc12Q8BW49 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ttc12Q8BW49 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ttc12Q8BW49 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ttc12Q8BW49 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Ttc12Q8BW49 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ttc12Q8BW49 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ttc12Q8BW49 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ttc12Q8BW49 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ttc12Q8BW49 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ttc12Q8BW49 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ttc12Q8BW49 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ttc12Q8BW49 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ttc12Q8BW49 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Ttc12Q8BW49 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ttc12Q8BW49 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ttc12Q8BW49 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ttc12Q8BW49 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ttc12Q8BW49 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ttc12Q8BW49 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ttc12Q8BW49 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ttc12Q8BW49 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ttc12Q8BW49 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Ttc12Q8BW49 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ttc12Q8BW49 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ttc12Q8BW49 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Ttc12Q8BW49 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ttc12Q8BW49 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ttc12Q8BW49 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ttc12Q8BW49 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ttc12Q8BW49 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ttc12Q8BW49 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ttc12Q8BW49 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ttc12Q8BW49 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ttc12Q8BW49 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ttc12Q8BW49 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ttc12Q8BW49 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ttc12Q8BW49 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ttc12Q8BW49 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ttc12Q8BW49 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Ttc12Q8BW49 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ttc12Q8BW49 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.72
Ttc12Q8BW49 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ttc12Q8BW49 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Ttc12Q8BW49 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ttc12Q8BW49 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ttc12Q8BW49 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ttc12Q8BW49 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ttc12Q8BW49 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ttc12Q8BW49 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ttc12Q8BW49 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ttc12Q8BW49 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ttc12Q8BW49 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ttc12Q8BW49 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ttc12Q8BW49 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ttc12Q8BW49 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ttc12Q8BW49 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ttc12Q8BW49 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ttc12Q8BW49 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ttc12Q8BW49 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ttc12Q8BW49 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ttc12Q8BW49 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ttc12Q8BW49 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ttc12Q8BW49 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ttc12Q8BW49 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ttc12Q8BW49 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ttc12Q8BW49 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ttc12Q8BW49 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ttc12Q8BW49 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ttc12Q8BW49 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ttc12Q8BW49 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ttc12Q8BW49 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Ttc12Q8BW49 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ttc12Q8BW49 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ttc12Q8BW49 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ttc12Q8BW49 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ttc12Q8BW49 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ttc12Q8BW49 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ttc12Q8BW49 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ttc12Q8BW49 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ttc12Q8BW49 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ttc12Q8BW49 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ttc12Q8BW49 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms