Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF4

Ccdc30, Coiled-coil domain-containing protein 30, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc30Q8BVF4 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ccdc30Q8BVF4 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ccdc30Q8BVF4 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ccdc30Q8BVF4 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ccdc30Q8BVF4 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ccdc30Q8BVF4 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ccdc30Q8BVF4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ccdc30Q8BVF4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ccdc30Q8BVF4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ccdc30Q8BVF4 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ccdc30Q8BVF4 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ccdc30Q8BVF4 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ccdc30Q8BVF4 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ccdc30Q8BVF4 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ccdc30Q8BVF4 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ccdc30Q8BVF4 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ccdc30Q8BVF4 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ccdc30Q8BVF4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ccdc30Q8BVF4 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Ccdc30Q8BVF4 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Ccdc30Q8BVF4 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Ccdc30Q8BVF4 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ccdc30Q8BVF4 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ccdc30Q8BVF4 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ccdc30Q8BVF4 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ccdc30Q8BVF4 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ccdc30Q8BVF4 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ccdc30Q8BVF4 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ccdc30Q8BVF4 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ccdc30Q8BVF4 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ccdc30Q8BVF4 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ccdc30Q8BVF4 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ccdc30Q8BVF4 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ccdc30Q8BVF4 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Ccdc30Q8BVF4 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Ccdc30Q8BVF4 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ccdc30Q8BVF4 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ccdc30Q8BVF4 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Ccdc30Q8BVF4 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Ccdc30Q8BVF4 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ccdc30Q8BVF4 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ccdc30Q8BVF4 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ccdc30Q8BVF4 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ccdc30Q8BVF4 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ccdc30Q8BVF4 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ccdc30Q8BVF4 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ccdc30Q8BVF4 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Ccdc30Q8BVF4 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ccdc30Q8BVF4 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ccdc30Q8BVF4 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ccdc30Q8BVF4 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ccdc30Q8BVF4 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ccdc30Q8BVF4 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ccdc30Q8BVF4 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ccdc30Q8BVF4 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Ccdc30Q8BVF4 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ccdc30Q8BVF4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ccdc30Q8BVF4 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ccdc30Q8BVF4 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ccdc30Q8BVF4 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ccdc30Q8BVF4 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ccdc30Q8BVF4 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ccdc30Q8BVF4 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ccdc30Q8BVF4 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ccdc30Q8BVF4 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ccdc30Q8BVF4 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ccdc30Q8BVF4 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ccdc30Q8BVF4 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ccdc30Q8BVF4 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ccdc30Q8BVF4 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ccdc30Q8BVF4 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ccdc30Q8BVF4 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ccdc30Q8BVF4 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ccdc30Q8BVF4 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ccdc30Q8BVF4 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ccdc30Q8BVF4 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ccdc30Q8BVF4 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ccdc30Q8BVF4 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ccdc30Q8BVF4 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ccdc30Q8BVF4 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ccdc30Q8BVF4 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ccdc30Q8BVF4 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ccdc30Q8BVF4 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ccdc30Q8BVF4 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ccdc30Q8BVF4 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ccdc30Q8BVF4 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ccdc30Q8BVF4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ccdc30Q8BVF4 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ccdc30Q8BVF4 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ccdc30Q8BVF4 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ccdc30Q8BVF4 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Ccdc30Q8BVF4 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ccdc30Q8BVF4 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ccdc30Q8BVF4 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ccdc30Q8BVF4 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ccdc30Q8BVF4 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ccdc30Q8BVF4 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ccdc30Q8BVF4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ccdc30Q8BVF4 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ccdc30Q8BVF4 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms