Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSF5

Klhl38, Kelch-like protein 38, mousemouse

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl38Q8BSF5 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Klhl38Q8BSF5 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Klhl38Q8BSF5 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Klhl38Q8BSF5 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Klhl38Q8BSF5 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Klhl38Q8BSF5 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Klhl38Q8BSF5 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Klhl38Q8BSF5 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Klhl38Q8BSF5 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Klhl38Q8BSF5 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Klhl38Q8BSF5 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Klhl38Q8BSF5 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Klhl38Q8BSF5 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Klhl38Q8BSF5 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Klhl38Q8BSF5 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Klhl38Q8BSF5 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Klhl38Q8BSF5 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Klhl38Q8BSF5 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Klhl38Q8BSF5 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Klhl38Q8BSF5 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Klhl38Q8BSF5 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Klhl38Q8BSF5 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Klhl38Q8BSF5 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Klhl38Q8BSF5 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Klhl38Q8BSF5 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Klhl38Q8BSF5 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Klhl38Q8BSF5 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Klhl38Q8BSF5 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Klhl38Q8BSF5 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Klhl38Q8BSF5 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Klhl38Q8BSF5 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Klhl38Q8BSF5 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Klhl38Q8BSF5 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Klhl38Q8BSF5 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Klhl38Q8BSF5 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Klhl38Q8BSF5 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Klhl38Q8BSF5 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Klhl38Q8BSF5 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Klhl38Q8BSF5 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Klhl38Q8BSF5 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Klhl38Q8BSF5 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Klhl38Q8BSF5 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Klhl38Q8BSF5 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Klhl38Q8BSF5 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Klhl38Q8BSF5 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Klhl38Q8BSF5 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Klhl38Q8BSF5 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Klhl38Q8BSF5 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Klhl38Q8BSF5 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Klhl38Q8BSF5 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Klhl38Q8BSF5 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Klhl38Q8BSF5 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Klhl38Q8BSF5 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Klhl38Q8BSF5 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Klhl38Q8BSF5 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Klhl38Q8BSF5 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Klhl38Q8BSF5 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Klhl38Q8BSF5 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Klhl38Q8BSF5 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Klhl38Q8BSF5 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Klhl38Q8BSF5 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Klhl38Q8BSF5 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Klhl38Q8BSF5 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Klhl38Q8BSF5 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Klhl38Q8BSF5 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Klhl38Q8BSF5 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Klhl38Q8BSF5 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Klhl38Q8BSF5 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Klhl38Q8BSF5 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Klhl38Q8BSF5 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Klhl38Q8BSF5 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Klhl38Q8BSF5 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Klhl38Q8BSF5 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Klhl38Q8BSF5 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Klhl38Q8BSF5 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Klhl38Q8BSF5 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Klhl38Q8BSF5 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Klhl38Q8BSF5 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Klhl38Q8BSF5 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Klhl38Q8BSF5 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Klhl38Q8BSF5 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Klhl38Q8BSF5 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Klhl38Q8BSF5 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Klhl38Q8BSF5 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Klhl38Q8BSF5 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Klhl38Q8BSF5 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Klhl38Q8BSF5 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Klhl38Q8BSF5 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Klhl38Q8BSF5 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Klhl38Q8BSF5 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Klhl38Q8BSF5 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Klhl38Q8BSF5 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Klhl38Q8BSF5 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Klhl38Q8BSF5 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Klhl38Q8BSF5 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Klhl38Q8BSF5 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Klhl38Q8BSF5 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Klhl38Q8BSF5 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Klhl38Q8BSF5 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Klhl38Q8BSF5 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms