Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKI2

Tnrc6b, Trinucleotide repeat-containing gene 6B protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnrc6bQ8BKI2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Tnrc6bQ8BKI2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Tnrc6bQ8BKI2 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Tnrc6bQ8BKI2 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Tnrc6bQ8BKI2 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC30■■■□□ 2.39
Tnrc6bQ8BKI2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Tnrc6bQ8BKI2 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
Tnrc6bQ8BKI2 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Tnrc6bQ8BKI2 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Tnrc6bQ8BKI2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Tnrc6bQ8BKI2 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Tnrc6bQ8BKI2 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Tnrc6bQ8BKI2 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Tnrc6bQ8BKI2 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Tnrc6bQ8BKI2 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Tnrc6bQ8BKI2 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Tnrc6bQ8BKI2 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Tnrc6bQ8BKI2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Tnrc6bQ8BKI2 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Tnrc6bQ8BKI2 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Tnrc6bQ8BKI2 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Tnrc6bQ8BKI2 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Tnrc6bQ8BKI2 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Tnrc6bQ8BKI2 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Tnrc6bQ8BKI2 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Tnrc6bQ8BKI2 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Tnrc6bQ8BKI2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Tnrc6bQ8BKI2 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Tnrc6bQ8BKI2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Tnrc6bQ8BKI2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Tnrc6bQ8BKI2 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Tnrc6bQ8BKI2 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Tnrc6bQ8BKI2 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Tnrc6bQ8BKI2 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Tnrc6bQ8BKI2 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
Tnrc6bQ8BKI2 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Tnrc6bQ8BKI2 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Tnrc6bQ8BKI2 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
Tnrc6bQ8BKI2 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Tnrc6bQ8BKI2 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
Tnrc6bQ8BKI2 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Tnrc6bQ8BKI2 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Tnrc6bQ8BKI2 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Tnrc6bQ8BKI2 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Tnrc6bQ8BKI2 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Tnrc6bQ8BKI2 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Tnrc6bQ8BKI2 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Tnrc6bQ8BKI2 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Tnrc6bQ8BKI2 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
Tnrc6bQ8BKI2 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Tnrc6bQ8BKI2 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
Tnrc6bQ8BKI2 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Tnrc6bQ8BKI2 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Tnrc6bQ8BKI2 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Tnrc6bQ8BKI2 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
Tnrc6bQ8BKI2 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Tnrc6bQ8BKI2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Tnrc6bQ8BKI2 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Tnrc6bQ8BKI2 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Tnrc6bQ8BKI2 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Tnrc6bQ8BKI2 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Tnrc6bQ8BKI2 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Tnrc6bQ8BKI2 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Tnrc6bQ8BKI2 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Tnrc6bQ8BKI2 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Tnrc6bQ8BKI2 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Tnrc6bQ8BKI2 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Tnrc6bQ8BKI2 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Tnrc6bQ8BKI2 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Tnrc6bQ8BKI2 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Tnrc6bQ8BKI2 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
Tnrc6bQ8BKI2 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Tnrc6bQ8BKI2 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Tnrc6bQ8BKI2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Tnrc6bQ8BKI2 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Tnrc6bQ8BKI2 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Tnrc6bQ8BKI2 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Tnrc6bQ8BKI2 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Tnrc6bQ8BKI2 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Tnrc6bQ8BKI2 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Tnrc6bQ8BKI2 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Tnrc6bQ8BKI2 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Tnrc6bQ8BKI2 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Tnrc6bQ8BKI2 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Tnrc6bQ8BKI2 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
Tnrc6bQ8BKI2 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Tnrc6bQ8BKI2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Tnrc6bQ8BKI2 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Tnrc6bQ8BKI2 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Tnrc6bQ8BKI2 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Tnrc6bQ8BKI2 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Tnrc6bQ8BKI2 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Tnrc6bQ8BKI2 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Tnrc6bQ8BKI2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Tnrc6bQ8BKI2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Tnrc6bQ8BKI2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Tnrc6bQ8BKI2 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Tnrc6bQ8BKI2 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Tnrc6bQ8BKI2 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Tnrc6bQ8BKI2 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 117.4 ms