Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGU0

Cyp4f39, Cytochrome P450, family 4, subfamily f, polypeptide 39, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp4f39Q8BGU0 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cyp4f39Q8BGU0 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Cyp4f39Q8BGU0 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Cyp4f39Q8BGU0 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cyp4f39Q8BGU0 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cyp4f39Q8BGU0 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cyp4f39Q8BGU0 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cyp4f39Q8BGU0 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cyp4f39Q8BGU0 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cyp4f39Q8BGU0 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cyp4f39Q8BGU0 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cyp4f39Q8BGU0 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cyp4f39Q8BGU0 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cyp4f39Q8BGU0 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cyp4f39Q8BGU0 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cyp4f39Q8BGU0 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cyp4f39Q8BGU0 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cyp4f39Q8BGU0 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cyp4f39Q8BGU0 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cyp4f39Q8BGU0 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cyp4f39Q8BGU0 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cyp4f39Q8BGU0 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cyp4f39Q8BGU0 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cyp4f39Q8BGU0 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cyp4f39Q8BGU0 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cyp4f39Q8BGU0 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cyp4f39Q8BGU0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cyp4f39Q8BGU0 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cyp4f39Q8BGU0 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cyp4f39Q8BGU0 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cyp4f39Q8BGU0 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cyp4f39Q8BGU0 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cyp4f39Q8BGU0 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cyp4f39Q8BGU0 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Cyp4f39Q8BGU0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cyp4f39Q8BGU0 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cyp4f39Q8BGU0 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cyp4f39Q8BGU0 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cyp4f39Q8BGU0 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cyp4f39Q8BGU0 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cyp4f39Q8BGU0 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cyp4f39Q8BGU0 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cyp4f39Q8BGU0 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cyp4f39Q8BGU0 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cyp4f39Q8BGU0 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cyp4f39Q8BGU0 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cyp4f39Q8BGU0 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cyp4f39Q8BGU0 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cyp4f39Q8BGU0 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cyp4f39Q8BGU0 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cyp4f39Q8BGU0 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cyp4f39Q8BGU0 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cyp4f39Q8BGU0 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cyp4f39Q8BGU0 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cyp4f39Q8BGU0 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Cyp4f39Q8BGU0 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Cyp4f39Q8BGU0 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cyp4f39Q8BGU0 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cyp4f39Q8BGU0 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cyp4f39Q8BGU0 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cyp4f39Q8BGU0 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cyp4f39Q8BGU0 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cyp4f39Q8BGU0 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cyp4f39Q8BGU0 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cyp4f39Q8BGU0 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cyp4f39Q8BGU0 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cyp4f39Q8BGU0 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cyp4f39Q8BGU0 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Cyp4f39Q8BGU0 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Cyp4f39Q8BGU0 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Cyp4f39Q8BGU0 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cyp4f39Q8BGU0 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cyp4f39Q8BGU0 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Cyp4f39Q8BGU0 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cyp4f39Q8BGU0 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cyp4f39Q8BGU0 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cyp4f39Q8BGU0 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cyp4f39Q8BGU0 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cyp4f39Q8BGU0 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cyp4f39Q8BGU0 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cyp4f39Q8BGU0 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cyp4f39Q8BGU0 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cyp4f39Q8BGU0 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cyp4f39Q8BGU0 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cyp4f39Q8BGU0 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cyp4f39Q8BGU0 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cyp4f39Q8BGU0 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cyp4f39Q8BGU0 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cyp4f39Q8BGU0 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Cyp4f39Q8BGU0 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cyp4f39Q8BGU0 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cyp4f39Q8BGU0 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cyp4f39Q8BGU0 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cyp4f39Q8BGU0 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cyp4f39Q8BGU0 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cyp4f39Q8BGU0 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cyp4f39Q8BGU0 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cyp4f39Q8BGU0 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cyp4f39Q8BGU0 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cyp4f39Q8BGU0 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms