Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW5

H2-M10.6, Histocompatibility 2, M region locus 10.6, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.6Q85ZW5 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2-M10.6Q85ZW5 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2-M10.6Q85ZW5 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
H2-M10.6Q85ZW5 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2-M10.6Q85ZW5 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2-M10.6Q85ZW5 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2-M10.6Q85ZW5 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2-M10.6Q85ZW5 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2-M10.6Q85ZW5 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2-M10.6Q85ZW5 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2-M10.6Q85ZW5 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
H2-M10.6Q85ZW5 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2-M10.6Q85ZW5 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2-M10.6Q85ZW5 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2-M10.6Q85ZW5 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2-M10.6Q85ZW5 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2-M10.6Q85ZW5 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
H2-M10.6Q85ZW5 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
H2-M10.6Q85ZW5 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
H2-M10.6Q85ZW5 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
H2-M10.6Q85ZW5 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
H2-M10.6Q85ZW5 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2-M10.6Q85ZW5 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2-M10.6Q85ZW5 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2-M10.6Q85ZW5 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
H2-M10.6Q85ZW5 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2-M10.6Q85ZW5 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2-M10.6Q85ZW5 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2-M10.6Q85ZW5 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2-M10.6Q85ZW5 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2-M10.6Q85ZW5 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
H2-M10.6Q85ZW5 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
H2-M10.6Q85ZW5 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
H2-M10.6Q85ZW5 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
H2-M10.6Q85ZW5 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
H2-M10.6Q85ZW5 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
H2-M10.6Q85ZW5 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2-M10.6Q85ZW5 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2-M10.6Q85ZW5 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2-M10.6Q85ZW5 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2-M10.6Q85ZW5 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2-M10.6Q85ZW5 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2-M10.6Q85ZW5 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2-M10.6Q85ZW5 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2-M10.6Q85ZW5 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2-M10.6Q85ZW5 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2-M10.6Q85ZW5 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2-M10.6Q85ZW5 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2-M10.6Q85ZW5 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2-M10.6Q85ZW5 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2-M10.6Q85ZW5 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2-M10.6Q85ZW5 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2-M10.6Q85ZW5 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2-M10.6Q85ZW5 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2-M10.6Q85ZW5 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2-M10.6Q85ZW5 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2-M10.6Q85ZW5 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2-M10.6Q85ZW5 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2-M10.6Q85ZW5 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2-M10.6Q85ZW5 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2-M10.6Q85ZW5 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2-M10.6Q85ZW5 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2-M10.6Q85ZW5 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2-M10.6Q85ZW5 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2-M10.6Q85ZW5 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2-M10.6Q85ZW5 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2-M10.6Q85ZW5 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2-M10.6Q85ZW5 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2-M10.6Q85ZW5 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2-M10.6Q85ZW5 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2-M10.6Q85ZW5 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2-M10.6Q85ZW5 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2-M10.6Q85ZW5 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2-M10.6Q85ZW5 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2-M10.6Q85ZW5 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
H2-M10.6Q85ZW5 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
H2-M10.6Q85ZW5 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
H2-M10.6Q85ZW5 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
H2-M10.6Q85ZW5 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
H2-M10.6Q85ZW5 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
H2-M10.6Q85ZW5 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
H2-M10.6Q85ZW5 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
H2-M10.6Q85ZW5 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
H2-M10.6Q85ZW5 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
H2-M10.6Q85ZW5 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
H2-M10.6Q85ZW5 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
H2-M10.6Q85ZW5 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
H2-M10.6Q85ZW5 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
H2-M10.6Q85ZW5 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
H2-M10.6Q85ZW5 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
H2-M10.6Q85ZW5 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
H2-M10.6Q85ZW5 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
H2-M10.6Q85ZW5 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
H2-M10.6Q85ZW5 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
H2-M10.6Q85ZW5 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
H2-M10.6Q85ZW5 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
H2-M10.6Q85ZW5 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
H2-M10.6Q85ZW5 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
H2-M10.6Q85ZW5 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
H2-M10.6Q85ZW5 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms