Protein–RNA interactions for Protein: Q810P3

Cdkn3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn3Q810P3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdkn3Q810P3 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdkn3Q810P3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdkn3Q810P3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdkn3Q810P3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdkn3Q810P3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdkn3Q810P3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdkn3Q810P3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdkn3Q810P3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdkn3Q810P3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdkn3Q810P3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdkn3Q810P3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdkn3Q810P3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdkn3Q810P3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdkn3Q810P3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdkn3Q810P3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdkn3Q810P3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdkn3Q810P3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdkn3Q810P3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdkn3Q810P3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdkn3Q810P3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdkn3Q810P3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdkn3Q810P3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdkn3Q810P3 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdkn3Q810P3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdkn3Q810P3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdkn3Q810P3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdkn3Q810P3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdkn3Q810P3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdkn3Q810P3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdkn3Q810P3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdkn3Q810P3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdkn3Q810P3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdkn3Q810P3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdkn3Q810P3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdkn3Q810P3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdkn3Q810P3 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdkn3Q810P3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdkn3Q810P3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdkn3Q810P3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdkn3Q810P3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdkn3Q810P3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdkn3Q810P3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdkn3Q810P3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdkn3Q810P3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdkn3Q810P3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdkn3Q810P3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdkn3Q810P3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdkn3Q810P3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdkn3Q810P3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdkn3Q810P3 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdkn3Q810P3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdkn3Q810P3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdkn3Q810P3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdkn3Q810P3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdkn3Q810P3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdkn3Q810P3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdkn3Q810P3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdkn3Q810P3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cdkn3Q810P3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cdkn3Q810P3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cdkn3Q810P3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdkn3Q810P3 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdkn3Q810P3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdkn3Q810P3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdkn3Q810P3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdkn3Q810P3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdkn3Q810P3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdkn3Q810P3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdkn3Q810P3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdkn3Q810P3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdkn3Q810P3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdkn3Q810P3 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdkn3Q810P3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdkn3Q810P3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdkn3Q810P3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdkn3Q810P3 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdkn3Q810P3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdkn3Q810P3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdkn3Q810P3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdkn3Q810P3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdkn3Q810P3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdkn3Q810P3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdkn3Q810P3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdkn3Q810P3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cdkn3Q810P3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cdkn3Q810P3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cdkn3Q810P3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cdkn3Q810P3 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Cdkn3Q810P3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cdkn3Q810P3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cdkn3Q810P3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdkn3Q810P3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdkn3Q810P3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdkn3Q810P3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdkn3Q810P3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdkn3Q810P3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdkn3Q810P3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdkn3Q810P3 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdkn3Q810P3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.8 ms