Protein–RNA interactions for Protein: Q80Y84

Kdm5b, Lysine-specific demethylase 5B, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5bQ80Y84 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Kdm5bQ80Y84 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
Kdm5bQ80Y84 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Kdm5bQ80Y84 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC34.48■■■■□ 3.11
Kdm5bQ80Y84 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
Kdm5bQ80Y84 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Kdm5bQ80Y84 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Kdm5bQ80Y84 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Kdm5bQ80Y84 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
Kdm5bQ80Y84 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Kdm5bQ80Y84 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
Kdm5bQ80Y84 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Kdm5bQ80Y84 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Kdm5bQ80Y84 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.1
Kdm5bQ80Y84 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
Kdm5bQ80Y84 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Kdm5bQ80Y84 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC34.44■■■■□ 3.1
Kdm5bQ80Y84 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Kdm5bQ80Y84 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
Kdm5bQ80Y84 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Kdm5bQ80Y84 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Kdm5bQ80Y84 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
Kdm5bQ80Y84 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
Kdm5bQ80Y84 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
Kdm5bQ80Y84 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Kdm5bQ80Y84 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Kdm5bQ80Y84 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC34.4■■■■□ 3.1
Kdm5bQ80Y84 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
Kdm5bQ80Y84 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Kdm5bQ80Y84 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
Kdm5bQ80Y84 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC34.39■■■■□ 3.1
Kdm5bQ80Y84 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Kdm5bQ80Y84 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
Kdm5bQ80Y84 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Kdm5bQ80Y84 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
Kdm5bQ80Y84 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Kdm5bQ80Y84 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
Kdm5bQ80Y84 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
Kdm5bQ80Y84 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC34.36■■■■□ 3.09
Kdm5bQ80Y84 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Kdm5bQ80Y84 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Kdm5bQ80Y84 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Kdm5bQ80Y84 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
Kdm5bQ80Y84 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Kdm5bQ80Y84 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Kdm5bQ80Y84 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Kdm5bQ80Y84 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Kdm5bQ80Y84 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Kdm5bQ80Y84 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Kdm5bQ80Y84 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
Kdm5bQ80Y84 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC34.35■■■■□ 3.09
Kdm5bQ80Y84 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
Kdm5bQ80Y84 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Kdm5bQ80Y84 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC34.34■■■■□ 3.09
Kdm5bQ80Y84 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Kdm5bQ80Y84 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Kdm5bQ80Y84 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Kdm5bQ80Y84 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Kdm5bQ80Y84 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Kdm5bQ80Y84 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
Kdm5bQ80Y84 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Kdm5bQ80Y84 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Kdm5bQ80Y84 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Kdm5bQ80Y84 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
Kdm5bQ80Y84 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC34.31■■■■□ 3.08
Kdm5bQ80Y84 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Kdm5bQ80Y84 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
Kdm5bQ80Y84 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Kdm5bQ80Y84 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Kdm5bQ80Y84 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Kdm5bQ80Y84 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
Kdm5bQ80Y84 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Kdm5bQ80Y84 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
Kdm5bQ80Y84 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Kdm5bQ80Y84 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Kdm5bQ80Y84 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.28■■■■□ 3.08
Kdm5bQ80Y84 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC34.28■■■■□ 3.08
Kdm5bQ80Y84 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Kdm5bQ80Y84 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Kdm5bQ80Y84 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Kdm5bQ80Y84 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Kdm5bQ80Y84 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Kdm5bQ80Y84 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
Kdm5bQ80Y84 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC34.25■■■■□ 3.07
Kdm5bQ80Y84 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC34.25■■■■□ 3.07
Kdm5bQ80Y84 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC34.25■■■■□ 3.07
Kdm5bQ80Y84 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
Kdm5bQ80Y84 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
Kdm5bQ80Y84 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Kdm5bQ80Y84 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Kdm5bQ80Y84 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.21■■■■□ 3.07
Kdm5bQ80Y84 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
Kdm5bQ80Y84 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
Kdm5bQ80Y84 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Kdm5bQ80Y84 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Kdm5bQ80Y84 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Kdm5bQ80Y84 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Kdm5bQ80Y84 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Kdm5bQ80Y84 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC34.2■■■■□ 3.06
Kdm5bQ80Y84 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms