Protein–RNA interactions for Protein: Q80UU2

Rpp38, Ribonuclease P protein subunit p38, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpp38Q80UU2 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rpp38Q80UU2 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Rpp38Q80UU2 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Rpp38Q80UU2 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rpp38Q80UU2 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rpp38Q80UU2 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rpp38Q80UU2 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Rpp38Q80UU2 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Rpp38Q80UU2 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rpp38Q80UU2 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rpp38Q80UU2 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rpp38Q80UU2 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rpp38Q80UU2 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rpp38Q80UU2 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rpp38Q80UU2 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rpp38Q80UU2 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rpp38Q80UU2 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Rpp38Q80UU2 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rpp38Q80UU2 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rpp38Q80UU2 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rpp38Q80UU2 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rpp38Q80UU2 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rpp38Q80UU2 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rpp38Q80UU2 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rpp38Q80UU2 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rpp38Q80UU2 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rpp38Q80UU2 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rpp38Q80UU2 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rpp38Q80UU2 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rpp38Q80UU2 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rpp38Q80UU2 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rpp38Q80UU2 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rpp38Q80UU2 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rpp38Q80UU2 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rpp38Q80UU2 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rpp38Q80UU2 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rpp38Q80UU2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Rpp38Q80UU2 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rpp38Q80UU2 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rpp38Q80UU2 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rpp38Q80UU2 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rpp38Q80UU2 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rpp38Q80UU2 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rpp38Q80UU2 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rpp38Q80UU2 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rpp38Q80UU2 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rpp38Q80UU2 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rpp38Q80UU2 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rpp38Q80UU2 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rpp38Q80UU2 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rpp38Q80UU2 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rpp38Q80UU2 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rpp38Q80UU2 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rpp38Q80UU2 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rpp38Q80UU2 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rpp38Q80UU2 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rpp38Q80UU2 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rpp38Q80UU2 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rpp38Q80UU2 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rpp38Q80UU2 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rpp38Q80UU2 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rpp38Q80UU2 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rpp38Q80UU2 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rpp38Q80UU2 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rpp38Q80UU2 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Rpp38Q80UU2 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rpp38Q80UU2 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rpp38Q80UU2 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rpp38Q80UU2 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rpp38Q80UU2 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rpp38Q80UU2 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rpp38Q80UU2 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rpp38Q80UU2 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rpp38Q80UU2 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rpp38Q80UU2 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rpp38Q80UU2 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rpp38Q80UU2 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rpp38Q80UU2 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rpp38Q80UU2 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rpp38Q80UU2 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rpp38Q80UU2 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rpp38Q80UU2 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rpp38Q80UU2 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rpp38Q80UU2 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rpp38Q80UU2 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rpp38Q80UU2 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rpp38Q80UU2 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rpp38Q80UU2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rpp38Q80UU2 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rpp38Q80UU2 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rpp38Q80UU2 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rpp38Q80UU2 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rpp38Q80UU2 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rpp38Q80UU2 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rpp38Q80UU2 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rpp38Q80UU2 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rpp38Q80UU2 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rpp38Q80UU2 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rpp38Q80UU2 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rpp38Q80UU2 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms