Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT28

Rexo1, RNA exonuclease 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo1Q7TT28 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rexo1Q7TT28 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rexo1Q7TT28 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rexo1Q7TT28 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rexo1Q7TT28 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rexo1Q7TT28 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rexo1Q7TT28 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rexo1Q7TT28 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rexo1Q7TT28 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rexo1Q7TT28 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rexo1Q7TT28 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rexo1Q7TT28 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rexo1Q7TT28 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rexo1Q7TT28 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rexo1Q7TT28 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rexo1Q7TT28 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rexo1Q7TT28 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Rexo1Q7TT28 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rexo1Q7TT28 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rexo1Q7TT28 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rexo1Q7TT28 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rexo1Q7TT28 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rexo1Q7TT28 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rexo1Q7TT28 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rexo1Q7TT28 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Rexo1Q7TT28 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rexo1Q7TT28 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rexo1Q7TT28 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Rexo1Q7TT28 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rexo1Q7TT28 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rexo1Q7TT28 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rexo1Q7TT28 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rexo1Q7TT28 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rexo1Q7TT28 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rexo1Q7TT28 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rexo1Q7TT28 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rexo1Q7TT28 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rexo1Q7TT28 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rexo1Q7TT28 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rexo1Q7TT28 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rexo1Q7TT28 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rexo1Q7TT28 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rexo1Q7TT28 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rexo1Q7TT28 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rexo1Q7TT28 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rexo1Q7TT28 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rexo1Q7TT28 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rexo1Q7TT28 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rexo1Q7TT28 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rexo1Q7TT28 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rexo1Q7TT28 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rexo1Q7TT28 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Rexo1Q7TT28 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rexo1Q7TT28 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rexo1Q7TT28 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rexo1Q7TT28 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rexo1Q7TT28 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rexo1Q7TT28 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rexo1Q7TT28 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rexo1Q7TT28 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rexo1Q7TT28 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Rexo1Q7TT28 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rexo1Q7TT28 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rexo1Q7TT28 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rexo1Q7TT28 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rexo1Q7TT28 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rexo1Q7TT28 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rexo1Q7TT28 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rexo1Q7TT28 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rexo1Q7TT28 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rexo1Q7TT28 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rexo1Q7TT28 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rexo1Q7TT28 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rexo1Q7TT28 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rexo1Q7TT28 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rexo1Q7TT28 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rexo1Q7TT28 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rexo1Q7TT28 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rexo1Q7TT28 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
Rexo1Q7TT28 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rexo1Q7TT28 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rexo1Q7TT28 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rexo1Q7TT28 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rexo1Q7TT28 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Rexo1Q7TT28 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rexo1Q7TT28 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rexo1Q7TT28 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rexo1Q7TT28 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rexo1Q7TT28 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rexo1Q7TT28 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rexo1Q7TT28 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rexo1Q7TT28 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rexo1Q7TT28 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rexo1Q7TT28 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rexo1Q7TT28 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rexo1Q7TT28 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rexo1Q7TT28 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rexo1Q7TT28 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rexo1Q7TT28 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rexo1Q7TT28 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms