Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNH6

Nphp3, Nephrocystin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp3Q7TNH6 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Nphp3Q7TNH6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Nphp3Q7TNH6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Nphp3Q7TNH6 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Nphp3Q7TNH6 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Nphp3Q7TNH6 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Nphp3Q7TNH6 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Nphp3Q7TNH6 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Nphp3Q7TNH6 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Nphp3Q7TNH6 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Nphp3Q7TNH6 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Nphp3Q7TNH6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Nphp3Q7TNH6 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Nphp3Q7TNH6 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Nphp3Q7TNH6 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Nphp3Q7TNH6 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Nphp3Q7TNH6 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Nphp3Q7TNH6 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Nphp3Q7TNH6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Nphp3Q7TNH6 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Nphp3Q7TNH6 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Nphp3Q7TNH6 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Nphp3Q7TNH6 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Nphp3Q7TNH6 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Nphp3Q7TNH6 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Nphp3Q7TNH6 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Nphp3Q7TNH6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Nphp3Q7TNH6 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Nphp3Q7TNH6 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Nphp3Q7TNH6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Nphp3Q7TNH6 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Nphp3Q7TNH6 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Nphp3Q7TNH6 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Nphp3Q7TNH6 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Nphp3Q7TNH6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Nphp3Q7TNH6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Nphp3Q7TNH6 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Nphp3Q7TNH6 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Nphp3Q7TNH6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Nphp3Q7TNH6 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Nphp3Q7TNH6 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Nphp3Q7TNH6 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Nphp3Q7TNH6 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Nphp3Q7TNH6 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Nphp3Q7TNH6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Nphp3Q7TNH6 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Nphp3Q7TNH6 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Nphp3Q7TNH6 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Nphp3Q7TNH6 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Nphp3Q7TNH6 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Nphp3Q7TNH6 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Nphp3Q7TNH6 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Nphp3Q7TNH6 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Nphp3Q7TNH6 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Nphp3Q7TNH6 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Nphp3Q7TNH6 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Nphp3Q7TNH6 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Nphp3Q7TNH6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Nphp3Q7TNH6 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Nphp3Q7TNH6 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Nphp3Q7TNH6 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Nphp3Q7TNH6 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Nphp3Q7TNH6 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Nphp3Q7TNH6 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Nphp3Q7TNH6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Nphp3Q7TNH6 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Nphp3Q7TNH6 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Nphp3Q7TNH6 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Nphp3Q7TNH6 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Nphp3Q7TNH6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Nphp3Q7TNH6 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Nphp3Q7TNH6 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Nphp3Q7TNH6 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Nphp3Q7TNH6 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Nphp3Q7TNH6 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Nphp3Q7TNH6 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Nphp3Q7TNH6 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Nphp3Q7TNH6 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Nphp3Q7TNH6 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Nphp3Q7TNH6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Nphp3Q7TNH6 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Nphp3Q7TNH6 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Nphp3Q7TNH6 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Nphp3Q7TNH6 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Nphp3Q7TNH6 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Nphp3Q7TNH6 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
Nphp3Q7TNH6 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Nphp3Q7TNH6 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Nphp3Q7TNH6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Nphp3Q7TNH6 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Nphp3Q7TNH6 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Nphp3Q7TNH6 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Nphp3Q7TNH6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Nphp3Q7TNH6 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Nphp3Q7TNH6 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Nphp3Q7TNH6 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Nphp3Q7TNH6 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Nphp3Q7TNH6 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Nphp3Q7TNH6 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Nphp3Q7TNH6 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105 ms